R中的光照校正或背景减法

Question

我有一个带照明渐变的图像。我需要在阈值处理之前进行光照校正。有没有简单的方法在R中进行光照校正或任何简单的数学运算？ EBImage包没有此功能。

Answer 1

一种方法称为平场校正。基本上，您将图像乘以：

correctionMatrix = mean(flatfieldImage) / flatFieldImage

其中flatfield是仅包含背景（您的渐变）的图像，mean(flatfield)是平场图像（标量）的平均值。如果进行逐元素划分，对于高强度背景，correctionMatrix将低于1，对于低强度背景，{{1}}将低于1。 correctionMatrix与您的图像之间的相乘将具有相当统一的背景，并且阈值处理应该有效。

如果您无法访问背景图像（仅限渐变），则可以使图像平滑到足以仅获得渐变。它不太精确，但也应该有效。