Question

给定一个包含2列，字符串和文件名的文件，如何用grep命令循环？还想将输出指向与不同文件夹中的SEQFILE相同的名称。相信以下是接近的，正确的引用缺失：

while IFS=" ", read SEQID SEQFILE
do
grep -A1 -m 1 ${SEQID} ${SEQFILE} > ./tmp/${SEQFILE}
done < missingSeq.txt

Answer 1

如果文件以逗号分隔，那么IFS=" ",没有意义，但如果它的空格分隔，则逗号会阻碍。这可能会解决您在上面提出的问题：

while IFS=' ' read id file; do
    grep -A1 -m1 "$id" "$file" > "./tmp/$file"
done < missingSeq.txt

Answer 2

IFS=' '
while read seq_id seq_file; do
   grep -A1 -m1 "$seq_id" "$seq_file" >> ./tep/seq_file    # i assume "tep" was actually meant
done < missingSeq.txt

解析文件行，在bash循环中使用多个变量

2 个答案: