在NetCDF中沿着无限维编写标量变量

时间:2014-07-02 19:05:45

标签: fortran fortran90 netcdf

我试图将流体动力学模型中的时间变量写入netcdf文件(无限维变量)。我在Fortran90中附加了一个简化的代码示例,突出了我的问题。

根据用户指定的输出间隔(本例中为10次),在模拟期间多次调用写入netcdf文件的子例程。我可以在第一次调用子例程时创建文件并添加属性。

我无法使启动和计数变量正确,以便在后续子程序调用期间将时间变量写入文件。这是错误,在编写模型时间变量时,我在尝试编译代码时收到:错误:没有特定功能的通用' nf90_put_var'

PROGRAM test_netcdf

  IMPLICIT NONE

  INTEGER :: N
  REAL :: time_step = 2.

  ! Call efdc_netcdf 10 times
  DO N=1,10

     CALL efdc_netcdf(N, time_step)

     time_step=time_step + 1.

  ENDDO

END PROGRAM test_netcdf

************************************
! Create NetCDF file and write variables
SUBROUTINE efdc_netcdf(N, time_step)

USE netcdf
IMPLICIT NONE

LOGICAL,SAVE::FIRST_NETCDF=.FALSE.
CHARACTER (len = *), PARAMETER :: FILE_NAME = "efdc_test.nc"
INTEGER :: ncid, status
INTEGER :: time_dimid
INTEGER :: ts_varid, time_varid

INTEGER :: start(1), count(1)
INTEGER :: deltat

INTEGER :: N
REAL :: time_step

start=(/N/)
count=(/1/)

! Create file and add attributes during first call of efdc_netcdf
IF(.NOT.FIRST_NETCDF)THEN

    status=nf90_create(FILE_NAME, NF90_CLOBBER, ncid)

    ! Define global attributes once
    status=nf90_put_att(ncid, NF90_GLOBAL, 'format', 'netCDF-3 64bit offset file')
    status=nf90_put_att(ncid, NF90_GLOBAL, 'os', 'Linux')
    status=nf90_put_att(ncid, NF90_GLOBAL, 'arch', 'x86_64')

    ! Define deltat variable
    status=nf90_def_var(ncid,'deltat',nf90_int,ts_varid)

    ! Define model time dimension
    status=nf90_def_dim(ncid,'efdc_time',nf90_unlimited,time_dimid)

    ! Define model time variable
    status=nf90_def_var(ncid,'efdc_time',nf90_real,time_dimid,time_varid)

    status=nf90_enddef(ncid)

    ! Put deltat during first call
    deltat=7
    status=nf90_put_var(ncid, ts_varid, deltat)

    FIRST_NETCDF=.TRUE.

ENDIF

! Put model time variable
status=nf90_put_var(ncid, time_varid, time_step, start=start, count=count)

! Close file at end of DO loop
IF(N.EQ.10) THEN
   status=nf90_close(ncid)
ENDIF

RETURN
END SUBROUTINE efdc_netcdf

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

问题在于编译器标记行:

status=nf90_put_var(ncid, time_varid, time_step, start=start, count=count)

您(正确地)尝试将标量变量time_step写入变量start的特定索引(time_varid),该变量在1-d,无限上定义 - 范围维度。但是,在这种情况下,可选参数计数没有意义;你正在编写标量,并且count只能是1.因此,nf90_put_var()使用单个标量进行输入的fortran绑定没有为count定义的可选参数,这就是为什么你'从编译器中获取“没有针对通用'nf90_put_var的特定函数”错误。这一切都是完全合理的,但错误信息和文档在确定如何解决问题方面都没有多大帮助。

您可以通过将time_step数据放入real, dimension(1)变量并将其放入,来修复代码;但最容易的就是摆脱计数规范,无论如何这里都没有必要:

status=nf90_put_var(ncid, time_varid, time_step, start=start)