Question

如何使用以下代码，以获得输入字符的补码？似乎循环永远不会结束，但是，如果我进入＆＃39; Z＆＃39;作为dna，为什么它不会破裂并退出？我是否使用了休息时间？ elif怎么样？

def get_complement（dna）：

''' (ch) -> ch

Reverse the 'A' to 'T' or vice versa and 'C' to 'G' and vice versa too.
>>> get_complement('A')
'C'
>>> get_complement('G')
'T'

'''
if dna == 'A':
    print ('C')
    if dna == 'C':
        print ('A')
        if dna == 'T':
            print ('G')
            if dna == 'G' :
                print ('T')
                while  {'A', 'C', 'G', 'T'}.isnotsubset(set(dna)) :
                    break
                return ('')

Answer 1

您应该使用dictionary

设置地图

complement = {'A': 'C', 'C': 'A', 'T': 'G', 'G': 'T'}

然后你可以做一些字符串

original = "ATCGTCA"
"".join(complement[letter] for letter in original)

输出

'CGATGAC'

仅限一个角色：

complement['A']

输出

'C'

Answer 2

正如你的例子所写（并且因为Cyber根据你的例子写了他的答案）你没有得到补充。你得到A - ＆gt; C（代替补码T），T - > G而不是A等

使用Cyber所做的字典，它应该如下所示：

complement = {'A':'T', 'T':'A', 'C':'G', 'G':'C'}

在代码中，包括检查非DNA字符：

original = "ATCGTCA"
bad_original = "ATCGTCAZ"

complement = {'A':'T', 'T':'A', 'C':'G', 'G':'C'}
for dna in (original, bad_original):
    try:
        output = "".join([complement[x] for x in dna])
    except KeyError:
        output = "Contains non-DNA characters"

    print output

“原始”产生“TAGCAGT”和“bad_original”产生“包含非DNA字符”。

请注意，这是补充，而不是反向补充，通常更有意义。

更一般地说，如果您打算将其用于DNA序列，您应该查看BioPython模块（http://biopython.org/wiki/Seq#Complement_and_reverse_complement），它将为您提供补充（和反向补充），具有更多功能，错误检查等等。

获得角色的补充

2 个答案: