我的表格格式如下:
foo - bar - 10 2e-5 0.0 some information
quz - baz - 4 1e-2 1 some other description in here
当我用熊猫打开它时:
a = pd.read_table("file", header=None, sep=" ")
它告诉我:
CParserError: Error tokenizing data. C error: Expected 9 fields in line 2, saw 12
我基本上喜欢的是类似于skiprows选项的东西,它允许我做类似的事情:
a = pd.read_table("file", header=None, sep=" ", skipcolumns=[8:])
我知道我可以使用awk
重新格式化此表,但我想知道是否存在Pandas解决方案。
感谢。
答案 0 :(得分:10)
usecols
参数允许您选择要使用的列:
a = pd.read_table("file", header=None, sep=" ", usecols=range(8))
但是,要接受不规则的列数,您还需要使用engine='python'
。
答案 1 :(得分:-2)
如果您使用的是Linux / OS X / Windows Cygwin,您应该能够按如下方式准备文件:
cat your_file | cut -d' ' -f1,2,3,4,5,6,7 > out.file
然后在Python中:
a = pd.read_table("out.file", header=None, sep=" ")
示例:强>
输入:
foo - bar - 10 2e-5 0.0 some information
quz - baz - 4 1e-2 1 some other description in here
输出:
foo - bar - 10 2e-5 0.0
quz - baz - 4 1e-2 1
您可以在命令行上手动运行此命令,或者只需使用subprocess
module在Python中调用它。