cbind具有相同列数的多个文件仍然出错“参数意味着不同的行数”

时间:2014-06-06 04:15:01

标签: r for-loop cbind

我有一个包含40个文件的文件夹(虽然我想编写代码以便它可以处理任意数量的文件,因为这会一直出现在我身上)。我想要做的就是获取一个新文件,将所有这些文件一起编译为列。每个文件包含5列,每列有902行。

这就是我写的:

Specs2 <- function() 
{
  allspecs2 <- NULL
  fnames2 <- scan(file.choose(), what = "character", quiet = TRUE)
  print(fnames2)
  for (i in fnames2) 

  {
    dat2 <- read.table(paste("E:\\Post-doc Data\\Colour-   Temperature\\Compiled Sets Rows\\",i, sep=""))
    value <- data.frame(dat2)
    allspecs2 = cbind(allspecs2, value)
  }

  allspecs2 <- data.frame(allspecs2)

  write.table(allspecs2, "E:\\Post-doc Data\\Colour-   Temperature\\Colour-Temperature_Columns.csv", row.names = FALSE, quote = FALSE)
}

Specs2()

当提示您选择文件时,我选择一个文件,其中包含我要编译的文件夹中所有文件的列表。当我运行此代码时,我收到以下错误代码:

"Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : arguments imply differing number of rows: 0, 902"

但我编译的所有文件都有相同的行数和列数。有谁知道我为什么会收到此错误或如何解决?或者用不同的编码方式来实现同样的目的?

谢谢!

编辑:所以在阅读了MrFlicks的回答之后,我理解为什么他的代码有效但我在成功之前使用了相同类型的代码:

Specs1 <- function() 
{
  allspecs1 <- NULL
  dirnames <- scan(file.choose(), what = "character", quiet = TRUE)
  print(dirnames)
  for (j in dirnames) 

{ 
 fnames1 <- list.files(path = paste("E:\\Post-doc Data\\Colour-Temperature\\Specs\\",j, sep = ""), pattern = NULL, all.files = FALSE, 
                      full.names = FALSE, recursive = FALSE,
                      ignore.case = TRUE, include.dirs = FALSE, no.. = FALSE)
print(fnames1)
for (i in fnames1) 

    {
      dat1 <- read.table(paste("E:\\Post-doc Data\\Colour-Temperature\\Specs\\",j,"\\",i, sep=""), skip = 17)
      smoothed <- ksmooth(dat1[,1], dat1[,2], kernel = "box", bandwidth = 10, x.points = seq(300, 2100, 2))
      allspecs1 = cbind(allspecs1, smoothed$y)          
    }

    allspecs1 = cbind(smoothed$x, allspecs1)
    allspecs1 <- data.frame(allspecs1)
    write.table(allspecs1, paste("E:\\Post-doc Data\\Colour-Temperature\\Compiled Sets Rows\\",j, ".txt"), row.names = FALSE,     col.names = FALSE, quote = FALSE)
    rm(allspecs1)
    allspecs1 = NULL  
  }
}

Specs1()

我只是想了解为什么它有效而不是其他人?

谢谢!

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

您收到该错误的原因与此错误相同

cbind(NULL, data.frame(a=1))
# Error in data.frame(..., check.names = FALSE) : 
#   arguments imply differing number of rows: 0, 1

首先定义allspecs2 <- NULL,当你将cbind第一个data.frame转到该空值时,就会触发错误。

最好先检查allspecs2是否包含任何行/列。 <怎么样

Specs2 <- function() 
{
  allspecs2 <- NULL
  fnames2 <- scan(file.choose(), what = "character", quiet = TRUE)
  print(fnames2)
  for (i in fnames2) {
    value <- read.table(paste("E:\\...\\",i, sep=""))
    if ( is.null(allspecs2) ) {
        allspecs2 <- value
    } else {
        allspecs2 <- cbind(allspecs2, value)
    }
  }
  write.table(allspecs2, "E:\\...\\file.csv", row.names = FALSE, quote = FALSE)
}

Specs2()