我有三个关于装饰器的问题,我无法找到答案:
Q1)PyMC中装饰器的参数(@Deterministic,@ Stochastic)表示什么?
Q2)
@pymc.stochastic(dtype=int)
def switchpoint(value=10, t_l=0, t_h=110):
def logp(value, t_l, t_h):
if value > t_h or value < t_l:
return -np.inf
else:
return -np.log(t_h - t_l + 1)
def random(t_l, t_h):
from numpy.random import random
return np.round( (t_l - t_h) * random() ) + t_l
1)打印switchpoint.logp #prints log-probability as expected
2)print switchpoint.random #does不生成随机数
3)print switchpoint.random()#生成一个随机数
4)print switchpoint.logp() #error
如果2没有工作,3工作,那么1应该没有工作,并且instaed 4应该工作(这与我观察到的相反)。有人可以解释发生了什么吗?
Q3)
@pymc.stochastic(dtype=int)
def switchpoint(value=1900, t_l=1851, t_h=1962):
if value > t_h or value < t_l:
# Invalid values
return -np.inf
else:
# Uniform log-likelihood
return -np.log(t_h - t_l + 1)
如果我输入logp
,这部分代码会执行吗?
switchpoint.logp
吗?
答案 0 :(得分:2)
Q1)随机记录的所有参数的含义都记录在案here。确定性的论据是相同的,加上记录here的其他论据。
Q2)行为的差异在于PyMC内部有一些神奇的实际执行switchpoint.logp
函数并将其转换为Python property
,而switchpoint.random
没有得到这个治疗,并作为一种功能保持。
如果你对实际发生的事情感到好奇,这里有一些相关的source:
def get_logp(self):
if self.verbose > 1:
print '\t' + self.__name__ + ': log-probability accessed.'
logp = self._logp.get()
if self.verbose > 1:
print '\t' + self.__name__ + ': Returning log-probability ', logp
try:
logp = float(logp)
except:
raise TypeError, self.__name__ + ': computed log-probability ' + str(logp) + ' cannot be cast to float'
if logp != logp:
raise ValueError, self.__name__ + ': computed log-probability is NaN'
# Check if the value is smaller than a double precision infinity:
if logp <= d_neg_inf:
if self.verbose > 0:
raise ZeroProbability, self.errmsg + ": %s" %self._parents.value
else:
raise ZeroProbability, self.errmsg
return logp
def set_logp(self,value):
raise AttributeError, 'Potential '+self.__name__+'\'s log-probability cannot be set.'
logp = property(fget = get_logp, fset=set_logp, doc="Self's log-probability value conditional on parents.")
还有一些其他的东西,比如logp
函数中的LazyFunction
,但这是基本的想法。
Q3)stochastic
装饰器中有一些(更多)魔术,它使用代码内省来确定random
中是否定义了logp
和switchpoint
个子函数。如果是,则使用logp
子函数来计算logp
,如果不是,则仅使用switchpoint
本身。该源代码为here:
# This gets used by stochastic to check for long-format logp and random:
if probe:
# Define global tracing function (I assume this is for debugging??)
# No, it's to get out the logp and random functions, if they're in there.
def probeFunc(frame, event, arg):
if event == 'return':
locals = frame.f_locals
kwds.update(dict((k,locals.get(k)) for k in keys))
sys.settrace(None)
return probeFunc
sys.settrace(probeFunc)
# Get the functions logp and random (complete interface).
# Disable special methods to prevent the formation of a hurricane of Deterministics
cur_status = check_special_methods()
disable_special_methods()
try:
__func__()
except:
if 'logp' in keys:
kwds['logp']=__func__
else:
kwds['eval'] =__func__
# Reenable special methods.
if cur_status:
enable_special_methods()
for key in keys:
if not kwds.has_key(key):
kwds[key] = None
for key in ['logp', 'eval']:
if key in keys:
if kwds[key] is None:
kwds[key] = __func__
同样,还有更多的东西在进行,而且相当复杂,但这是基本的想法。