R中的2D直方图:在列内从计数转换为频率

时间:2014-05-27 02:13:17

标签: r frequency heatmap histogram2d

非常感谢帮助生成频率的二维直方图,其中频率在列内计算。我的主要问题:从计数转换为基于列的频率。

这是我的首发代码:

# expected packages
library(ggplot2)
library(plyr)

# generate example data corresponding to expected data input
x_data = sample(101:200,10000, replace = TRUE)
y_data = sample(1:100,10000, replace = TRUE)
my_set = data.frame(x_data,y_data)

# define x and y interval cut points
x_seq = seq(100,200,10)
y_seq = seq(0,100,10)

# label samples as belonging within x and y intervals
my_set$x_interval = cut(my_set$x_data,x_seq)
my_set$y_interval = cut(my_set$y_data,y_seq)

# determine count for each x,y block
xy_df = ddply(my_set, c("x_interval","y_interval"),"nrow") # still need to convert for use with dplyr

# convert from count to frequency based on formula: freq = count/sum(count in given x interval)
################ TRYING TO FIGURE OUT #################

# plot results
fig_count <- ggplot(xy_df, aes(x = x_interval, y = y_interval)) + geom_tile(aes(fill = nrow)) # count
fig_freq <- ggplot(xy_df, aes(x = x_interval, y = y_interval)) + geom_tile(aes(fill = freq)) # frequency

我很感激如何计算列中的频率。

谢谢! JAC

编辑:我认为解决方案需要以下步骤 1)计算并存储每个x区间因子的总计数 2)将单个bin计数除以其对应的x-interval因子计数以获得频率。

不知道如何进行此操作。 。

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

如果要对x_interval值进行标准化,可以创建一个每个间隔计数的列,然后除以该值。我必须承认我不是ddply wiz所以也许它有一个更简单的方法,但我会这样做

xy_df$xnrows<-with(xy_df, ave(nrow, x_interval, FUN=sum))

然后

fig_freq <- ggplot(xy_df, aes(x = x_interval, y = y_interval)) +
    geom_tile(aes(fill = nrow/xnrows))