Question

我有2个文件，Rfile.R和Cppfile.cpp。

Cppfile.cpp中的内容：

#include <Rcpp.h>
using namespace Rcpp;
// [[Rcpp::export]]
int CPPF(int k){return ++k;}

Rfile.R中的内容：

RF<-function(k){return(CPPF(k))}

我想基于2个文件构建一个R包。我使用最新版本的Rstudio和Roxygen2。

我尝试了3种方法来构建包含或不包含Roxygen2的包，并且有不同的结果：

新项目 - ＆gt;新目录 - ＆gt; R package-＆gt;类型：包w / Rcpp，将Rfile.R和Cppfile.cpp都添加为源文件。建设与发展重装，一切都很好。这些功能可以正常工作。
新项目 - ＆gt;新目录 - ＆gt; R package-＆gt;类型：包w / Rcpp，将Rfile.R和Cppfile.cpp都添加为源文件。选择＆＃34;使用Roxygen＆＃34;生成文档，检查其所有选项。建设与发展重新加载，功能不起作用。输入＆＃34; RF＆＃34;给出RF的内容，输入＆＃34; CPPF＆＃34; pops＆＃34;找不到对象＆＃34;。
新项目 - ＆gt;新目录 - ＆gt; R package-＆gt;类型：包w / Rcpp，仅添加Cppfile.cpp作为源文件。选择＆＃34;使用Roxygen＆＃34;生成文档，检查其所有选项。建设与发展重新加载，功能正常。然后将Rfile.R直接复制到项目文件夹 - ＆gt; R文件夹中。建设与发展重新加载，一切正常，功能运作良好。

我使用的是Roxygen错误还是Roxygen有错误？我需要它来记录。我可以坚持第三种方式，这需要花费很多精力才能找到，但有线。

谢谢！

解决问题的一种方法：选择＆＃34;使用Roxygen＆＃34;生成文档时，请不要检查＆＃34; NAMESPACE文件＆＃34;选项。

Answer 1

你混淆了两件事（不幸的是很容易混淆）：

首先，// [[Rcpp::export]]属性用于在两个文件RcppExports.cpp和RcppExports.R中自动生成包装函数。包装器R函数CPPF将由Rcpp::compileAttributes()在此处自动生成，并放入R/RcppExports.R。

其次，roxygen条评论可用于管理NAMESPACE，例如使用@export标记。请注意，这与<{1}}的不同！

自动生成的功能不自动导出。 // [[Rcpp::export]]将生成一个Rcpp.package.skeleton()文件，该文件会自动导出给定名称的所有函数;即，NAMESPACE条目。这对于小包装来说已经足够了;但随着您的软件包变得越来越复杂，您将需要对命名空间进行更细粒度的控制。或者您可以采用一种约定，其中所有内部非导出函数都以exportPattern("^[[:alpha:]]+")开头。无论哪种方式，这种机制都允许将自动生成的函数导出到包命名空间。

如果要使用.来管理roxygen，则需要在C ++函数中添加NAMESPACE条注释，以便在命名空间中导出它们。因此，您可以按以下方式修改您的功能：

roxygen

请注意，对于#include <Rcpp.h> using namespace Rcpp; //' @export // [[Rcpp::export]] int CPPF(int k){return ++k;}的新版本，您可能必须运行roxygen2::upgradeRoxygen()以确保roxygen2接管NAMESPACE。

Answer 2

因此，如果2.不起作用，请将其作为roxygen2团队的（可重现的）错误报告提交。

我看不到Rcpp问题; Imports：/ NAMESPACE声明可能出现问题。我在这里看不到Rcpp问题（因为1.工作正常）。

FWIW我也在某些软件包上使用roxygen2，我也不时在RStudio中构建它们。

使用roxygen2构建R包时出错

2 个答案: