Question

我是r的新手（具有MatLab的经验）。我仍在探索语法并学习以R方式思考。

我在data.frame类中有一些数据（3000 x 3000），以下代码似乎表现得非常慢。

data[is.na(data)] = 0

我想从一些有经验的用户那里得到一些评论。谢谢。

Answer 1

假设您只是尝试将NA替换为0且您拥有所有数字，请使用矩阵。

x <- matrix(runif(9e+06,0,100),ncol=3000)
x[x <= 55 & x >= 54] <- NA
table(is.na(x))
  FALSE    TRUE 
8910086   89914
x[is.na(x)] <- 0
table(is.na(x))
  FALSE 
9000000

编辑：上面的转换只需不到1秒作为矩阵，但仍然只有3秒作为data.frame（不包括表命令，这是那里最慢的部分）。当你说的很慢时，你的意思是什么时候？

编辑：对Simon的回应

system.time(is.na(x) <- 0)
user  system elapsed 
0.024   0.044   0.068 # yes faster
table(is.na(x))
FALSE    TRUE 
8909945   90055 # doesn't change x
system.time(x[is.na(x)] <- 0)
user  system elapsed 
0.252   0.032   0.287 # slower
table(is.na(x))
FALSE 
9000000 # changes x

使用is.na作为索引缓慢

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