如何结合fasta文件?

时间:2014-05-06 22:35:23

标签: sequence cat fasta

我的问题是将两个基因序列连接成一个组合文件。以下是四个示例文件名

IMB211_trasncripts.renamed-20175.fa
IMB211_trasncripts.renamed-20176.fa
R500_trasncripts.renamed-20175.fa
R500_trasncripts.renamed-20176.fa

基本上我想将IMB211_trasncripts.renamed-20175.faR500_trasncripts.renamed-20175.faIMB211_trasncripts.renamed-20176.faR500_trasncripts.renamed-20176.fa连接起来。我知道使用cat命令很简单。

cat MB211_trasncripts.renamed-20175.fa R500_trasncripts.renamed-20175.fa > test_comb-20175.fa

然而,我有大约4万个这样的基因(每个基因用于IMB211和R500),所以我想知道是否有一种简单的方法可以将这些文件连接成一个特定于每个基因id的文件?

由于

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