Bio.PDB.Superimposer - 什么是RMS？

Question

我正在比较两个结构，并对结果参数的含义有点困惑： super_imposer.rms中保存的返回值是多少？ 我猜这是RMSD，但为什么不这样写呢？

Answer 1

super_imposer.rms确实是均方根偏差。

如果您咨询source of Bio.PDB.Superimposer，则会发现rms属性是调用get_rms()的结果。 get_rms()的文档字符串读取：

  

叠加坐标的均方根偏差。

教程确实说"The RMSD is stored in the rmsd attribute,"。不知道为什么存在这种差异。