罗莎琳德决议诺布

时间:2014-04-29 16:56:25

标签: python string bioinformatics rosalind

这是我对此处提出的问题的解决方案:http://rosalind.info/problems/subs/

def subs(string,subString):
    lista=[]
    i=0
    while i < (len(string)-len(subString)):
        if string[i:(i+len(subString)-1)]==subString:
           lista.append(i)
        i+=1
    return lista

我的代码出了什么问题?

3 个答案:

答案 0 :(得分:1)

您也可以使用正则表达式执行此操作,如下所示:

[m.start()+1 for m in re.finditer("(?=ATAT)", "GATATATGCATATACTT")])

答案 1 :(得分:0)

有一点是错误的是你不能在列表中添加一个整数,你需要追加它:

lista.append(i)

然后切片太短:在Python中,a[i:j]会为您提供从位置i但不包括位置j的所有字符。因为你从长度中减去1,所以每次比较一个字符太少。

最后,要获得问题中要求的确切答案,您需要在该位置添加1,因为Python将数组从0开始索引,而不是从1开始。

def subs(string,subString):
    lista = []
    i = 0
    while i < (len(string)-len(subString)):
        if string[i:i+len(subString)] == subString:
           lista.append(i + 1)
        i += 1
    return lista

答案 2 :(得分:0)

所有功能风格:D

def mysub2(string, sub):    
    return [x+1 for x in range(len(string)) if string[x:x+len(sub)] == sub]




>>> def mysub(string, sub):          
    return [x+1 for x in range(len(string)) if string[x:x+len(sub)] == sub]

>>> st = "GATATATGCATATACTT"
>>> sub2 = "ATAT"
>>> mysub(st, sub2)
[2, 4, 10]
>>>