根据不等时间戳加入data.tables

时间:2014-04-21 11:10:50

标签: r data.table

我正在努力解决与合并两个data.tables(尽管它也可能是data.frames)相关的问题,这个问题基于不相等的时间戳(POSIXct)。 根据表 A 中的某个时间戳,我希望R将表 B 中的条目之前返回到< EM> A 的

示例:

我有表格A ,其中包含有关某个时间点的活动的数据。

编辑:这是与原始帖子不同的数据,可以更好地反映问题:我需要根据时间戳和我称之为站点ID的分组变量进行“查找”。抱怨道,首先不清楚。

             Start.Time Start.Station.ID
1: 2014-04-06 18:24:32              238
2: 2014-04-06 18:20:30              238
3: 2014-04-06 01:04:13              373
4: 2014-04-06 01:03:36              373
5: 2014-04-06 01:03:37              373
6: 2014-04-06 01:03:01              373
7: 2014-04-06 01:02:42              373
8: 2014-04-06 01:02:31              373

我想在该表A中添加一个列,用于指示该站的状态在某个时间点的“可用性”。这些状态可在表B 中找到。

              status_dt station_id availability
 1: 2014-04-06 00:29:02        238    0.9354839
 2: 2014-04-06 00:29:02        373    1.0000000
 3: 2014-04-06 01:29:03        238    1.0000000
 4: 2014-04-06 01:29:03        373    0.6111111
 5: 2014-04-06 02:59:03        238    0.9354839
 6: 2014-04-06 02:59:03        373    0.6666667
    ...
41: 2014-04-06 17:59:03        238    0.8387097
42: 2014-04-06 17:59:03        373    0.4444444
43: 2014-04-06 18:59:03        238    0.9032258
44: 2014-04-06 18:59:03        373    0.5000000
45: 2014-04-06 20:29:03        238    0.7741935
              status_dt station_id availability

时间戳不匹配,因此我想在表A中的时间戳之前的观察中向表A添加表B中的状态。

预期结果将是例如列'可用性':

             status_dt station_id availability 
1: 2014-04-06 18:24:32        238    0.8387097         
2: 2014-04-06 18:20:30        238    0.8387097            
3: 2014-04-06 01:04:13        373    1.0000000            
4: 2014-04-06 01:03:36        373    1.0000000           
5: 2014-04-06 01:03:37        373    1.0000000            
6: 2014-04-06 01:03:01        373    1.0000000          
7: 2014-04-06 01:02:42        373    1.0000000           
8: 2014-04-06 01:02:31        373    1.0000000          

如果Start.Station.ID/station_id中的条目是唯一的,但BodieG的建议有效,但将此建议应用于此数据会给出

             status_dt station_id availability Start.Station.ID
1: 2014-04-06 18:24:32        373    0.4444444              238
2: 2014-04-06 18:20:30        373    0.4444444              238
3: 2014-04-06 01:04:13        373    1.0000000              373
4: 2014-04-06 01:03:36        373    1.0000000              373
5: 2014-04-06 01:03:37        373    1.0000000              373
6: 2014-04-06 01:03:01        373    1.0000000              373
7: 2014-04-06 01:02:42        373    1.0000000              373
8: 2014-04-06 01:02:31        373    1.0000000              373

前两行中的条目不是我预期的(或者更确切地说是希望的):它们是指第373站而不是238中的“可用性”。

我想代码只需要进行调整以反映时间戳和电台ID,但我在这里碰到了我的头。 另外我无法弄清楚是否使用建议的xts-package会有所帮助,因为很明显我在这里有重复的时间步骤......

同样,任何提示都非常感激。 提前谢谢!

重现性:
表A:

structure(list(Start.Time = structure(c(1396808672, 1396808430, 
1396746253, 1396746216, 1396746217, 1396746181, 1396746162, 1396746151
), class = c("POSIXct", "POSIXt"), tzone = "UTC"), Start.Station.ID = c(238, 
238, 373, 373, 373, 373, 373, 373)), .Names = c("Start.Time", 
"Start.Station.ID"), class = c("data.table", "data.frame"), row.names = c(NA, 
-8L))

表B:

   structure(list(status_dt = structure(c(1396744142, 1396744142, 
1396747743, 1396747743, 1396753143, 1396753143, 1396754942, 1396754942, 
1396756743, 1396756743, 1396758542, 1396758542, 1396760343, 1396760343, 
1396765743, 1396765743, 1396767542, 1396767542, 1396772943, 1396772943, 
1396778402, 1396778402, 1396781943, 1396781943, 1396785542, 1396785542, 
1396787342, 1396787342, 1396790942, 1396790942, 1396794543, 1396794543, 
1396798143, 1396798143, 1396799943, 1396799943, 1396801743, 1396801743, 
1396805343, 1396805343, 1396807143, 1396807143, 1396810743, 1396810743, 
1396816143, 1396816143, 1396817942, 1396817942, 1396821542, 1396821542, 
1396826942, 1396826942), class = c("POSIXct", "POSIXt"), tzone = "UTC"), 
    station_id = c(238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 
    373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 
    373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 
    373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 373, 238, 
    373, 238, 373, 238, 373, 238, 373), availability = c(0.935483870967742, 
    1, 1, 0.611111111111111, 0.935483870967742, 0.666666666666667, 
    0.967741935483871, 0.666666666666667, 0.967741935483871, 
    0.666666666666667, 0.935483870967742, 0.666666666666667, 
    0.967741935483871, 0.666666666666667, 0.967741935483871, 
    0.611111111111111, 0.967741935483871, 0.611111111111111, 
    1, 0.444444444444444, 0.870967741935484, 0.5, 0.806451612903226, 
    0.5, 0.774193548387097, 0.388888888888889, 0.709677419354839, 
    0.388888888888889, 0.67741935483871, 0.333333333333333, 1, 
    0.5, 0.903225806451613, 0.444444444444444, 0.935483870967742, 
    0.444444444444444, 0.903225806451613, 0.444444444444444, 
    0.870967741935484, 0.444444444444444, 0.838709677419355, 
    0.444444444444444, 0.903225806451613, 0.5, 0.774193548387097, 
    0.611111111111111, 0.766666666666667, 0.611111111111111, 
    0.774193548387097, 0.555555555555556, 0.870967741935484, 
    0.666666666666667)), .Names = c("status_dt", "station_id", 
"availability"), class = c("data.table", "data.frame"), row.names = c(NA, 
-52L), sorted = "status_dt")

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您可以使用roll参数:

setkey(B, status_dt)
B[A, roll=TRUE]

产地:

              status_dt station_id availability Start.Station.ID
 1: 2014-04-06 21:07:42        225    0.4864865              225
 2: 2014-04-06 21:06:50        225    0.4864865              225
 3: 2014-04-06 21:06:49        225    0.4864865              225
 4: 2014-04-06 21:06:15        225    0.4864865              225
 5: 2014-04-06 21:04:35        225    0.4864865              225
 6: 2014-04-06 21:05:33        225    0.4864865              225
 7: 2014-04-06 21:04:45        225    0.4864865              225
 8: 2014-04-06 21:04:37        225    0.4864865              225
 9: 2014-04-06 21:04:35        225    0.4864865              225
10: 2014-04-06 21:01:45        225    0.4864865              225
11: 2014-04-06 21:00:57        225    0.4864865              225
12: 2014-04-06 20:59:04        225    0.4864865              225
13: 2014-04-06 20:58:04        225    0.8648649              225
14: 2014-04-06 20:57:22        225    0.8648649              225
15: 2014-04-06 20:57:24        225    0.8648649              225
16: 2014-04-06 20:56:40        225    0.8648649              225
17: 2014-04-06 20:55:52        225    0.8648649              225
18: 2014-04-06 20:55:25        225    0.8648649              225
19: 2014-04-06 20:55:24        225    0.8648649              225
20: 2014-04-06 20:55:00        225    0.8648649              225
21: 2014-04-06 18:25:30        225    0.9729730              225
22: 2014-04-06 18:25:28        225    0.9729730              225
              status_dt station_id availability Start.Station.ID

这与您的预期输出非常匹配,除了它有一些额外的行,据我所知,根据您对问题的描述是合法的。

答案 1 :(得分:2)

我主要使用基本上为此编写的zooxts个包。

R> dfA <- as.data.frame(A)
R> a <- xts(dfA[,2], order.by=dfA[,1])
R> dfB <- as.data.frame(B)
R> b <- xts(dfB[,-1], order.by=dfB[,1])

现在我们有两个xts对象,我们只需merge()并在结果上运行na.locf()就可以使用先前值填充NA

R> na.locf(merge(a, b))
                      a station_id availability
2014-04-06 17:59:03  NA        225     0.972973
2014-04-06 18:25:28 225        225     0.972973
2014-04-06 18:25:30 225        225     0.972973
2014-04-06 18:59:03 225        225     0.621622
2014-04-06 20:29:03 225        225     0.864865
2014-04-06 20:55:00 225        225     0.864865
2014-04-06 20:55:24 225        225     0.864865
2014-04-06 20:55:25 225        225     0.864865
2014-04-06 20:55:52 225        225     0.864865
2014-04-06 20:56:40 225        225     0.864865
2014-04-06 20:57:22 225        225     0.864865
2014-04-06 20:57:24 225        225     0.864865
2014-04-06 20:58:04 225        225     0.864865
2014-04-06 20:59:02 225        225     0.486486
2014-04-06 20:59:04 225        225     0.486486
2014-04-06 21:00:57 225        225     0.486486
2014-04-06 21:01:45 225        225     0.486486
2014-04-06 21:04:35 225        225     0.486486
2014-04-06 21:04:35 225        225     0.486486
2014-04-06 21:04:37 225        225     0.486486
2014-04-06 21:04:45 225        225     0.486486
2014-04-06 21:05:33 225        225     0.486486
2014-04-06 21:06:15 225        225     0.486486
2014-04-06 21:06:49 225        225     0.486486
2014-04-06 21:06:50 225        225     0.486486
2014-04-06 21:07:42 225        225     0.486486
2014-04-06 21:59:02 225        225     0.162162
2014-04-06 23:29:02 225        225     0.162162
R> 

但是这里也应该有一个data.table答案......

编辑:根据评论,此处仅合并a个时间戳:

R> na.locf(merge(a, b))[index(a), -1]
                    station_id availability
2014-04-06 18:25:28        225     0.972973
2014-04-06 18:25:30        225     0.972973
2014-04-06 20:55:00        225     0.864865
2014-04-06 20:55:24        225     0.864865
2014-04-06 20:55:25        225     0.864865
2014-04-06 20:55:52        225     0.864865
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在这种特殊情况下,我还删除了冗余站ID列。