rmagic(rpy2)导致ipython笔记本中的内核崩溃(Mac OSX)

时间:2014-04-14 15:28:57

标签: ipython ipython-notebook rpy2

我已经尝试过去6个月的大部分时间来在ipython笔记本中运行rmagic函数扩展 - 我在MacOS上 - 当我尝试加载rmagic时,内核崩溃了。

我在之前版本的ipython笔记本中使用了rpy2,但是在这两个方面,两者停止了通信。我已经安装,重新安装,重新安装,并在屏幕上砸了我的头。

我尝试从pip,easy_install更新rpy2,并从源代码编译。

用于Windows的

This解决方案对我没有帮助。 This一个人也没有帮助。

当我来自env ARCHFLAGS="-arch i386 -arch x86_64" python setup.py build install时,我会遇到分段错误。

这是我一直得到的错误:

sudo env ARCHFLAGS="-arch i386 -arch x86_64" python setup.py build install
running build
running build_py
running build_ext
Configuration for R as a library:
include_dirs: ('/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include',)
libraries: ('Rblas', 'Rlapack')
library_dirs: ('/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib',)
extra_link_args: ('-framework R', '-F/Library/Frameworks/R.framework/..')
# OSX-specific (included in extra_link_args)
framework_dirs: ('-F/Library/Frameworks/R.framework/..',)
frameworks: ('-framework R',)
building 'rpy2.rinterface._rinterface' extension
cc -fno-strict-aliasing -fno-common -dynamic -g -Os -pipe -fno-common -fno-strict-    aliasing -fwrapv -mno-fused-madd -DENABLE_DTRACE -DMACOSX -DNDEBUG -Wall -Wstrict-prototypes -Wshorten-64-to-32 -DNDEBUG -g -fwrapv -Os -Wall -Wstrict-prototypes -DENABLE_DTRACE -pipe -arch i386 -arch x86_64 -DR_INTERFACE_PTRS=1 -DHAVE_POSIX_SIGJMP=1 -DCSTACK_DEFNS=1 -DRIF_HAS_RSIGHAND=1 -I./rpy/rinterface -I/System/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/include/python2.7 -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -c ./rpy/rinterface/_rinterface.c -o build/temp.macosx-10.9-intel-2.7/./rpy/rinterface/_rinterface.o
clang: error: unknown argument: '-mno-fused-madd' [-Wunused-command-line-argument-hard-error-in-future]
clang: note: this will be a hard error (cannot be downgraded to a warning) in the future
error: command 'cc' failed with exit status 1

有没有人有更多我可以尝试的建议?非常感谢任何建议。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

在构建rpy2之前设置这些环境变量:

export CFLAGS=-Qunused-arguments
export CPPFLAGS=-Qunused-arguments

请参阅here了解详情。