用seaborn绘制时间序列数据

Question

假设我使用以下内容创建一个完全随机的Dataframe：

from pandas.util import testing
from random import randrange

def random_date(start, end):
    delta = end - start
    int_delta = (delta.days * 24 * 60 * 60) + delta.seconds
    random_second = randrange(int_delta)
    return start + timedelta(seconds=random_second)

def rand_dataframe():
  df = testing.makeDataFrame()
  df['date'] = [random_date(datetime.date(2014,3,18),datetime.date(2014,4,1)) for x in xrange(df.shape[0])]
  df.sort(columns=['date'], inplace=True)      
  return df

df = rand_dataframe()

导致此帖子底部显示的数据框。我想使用A中的timeseries可视化功能来绘制我的列B，C，D和seaborn以便我得到一些内容沿着这些方向：

我该如何处理这个问题？从我在this notebook上看到的内容，调用应该是：

sns.tsplot(df, time="time", unit="unit", condition="condition", value="value")

但这似乎要求数据框以不同的方式表示，列以某种方式编码time，unit，condition和value，这不是我的情况。如何将我的数据帧（如下所示）转换为这种格式？

这是我的数据框：

      date         A         B         C         D

2014-03-18  1.223777  0.356887  1.201624  1.968612
2014-03-18  0.160730  1.888415  0.306334  0.203939
2014-03-18 -0.203101 -0.161298  2.426540  0.056791
2014-03-18 -1.350102  0.990093  0.495406  0.036215
2014-03-18 -1.862960  2.673009 -0.545336 -0.925385
2014-03-19  0.238281  0.468102 -0.150869  0.955069
2014-03-20  1.575317  0.811892  0.198165  1.117805
2014-03-20  0.822698 -0.398840 -1.277511  0.811691
2014-03-20  2.143201 -0.827853 -0.989221  1.088297
2014-03-20  0.299331  1.144311 -0.387854  0.209612
2014-03-20  1.284111 -0.470287 -0.172949 -0.792020
2014-03-22  1.031994  1.059394  0.037627  0.101246
2014-03-22  0.889149  0.724618  0.459405  1.023127
2014-03-23 -1.136320 -0.396265 -1.833737  1.478656
2014-03-23 -0.740400 -0.644395 -1.221330  0.321805
2014-03-23 -0.443021 -0.172013  0.020392 -2.368532
2014-03-23  1.063545  0.039607  1.673722  1.707222
2014-03-24  0.865192 -0.036810 -1.162648  0.947431
2014-03-24 -1.671451  0.979238 -0.701093 -1.204192
2014-03-26 -1.903534 -1.550349  0.267547 -0.585541
2014-03-27  2.515671 -0.271228 -1.993744 -0.671797
2014-03-27  1.728133 -0.423410 -0.620908  1.430503
2014-03-28 -1.446037 -0.229452 -0.996486  0.120554
2014-03-28 -0.664443 -0.665207  0.512771  0.066071
2014-03-29 -1.093379 -0.936449 -0.930999  0.389743
2014-03-29  1.205712 -0.356070 -0.595944  0.702238
2014-03-29 -1.069506  0.358093  1.217409 -2.286798
2014-03-29  2.441311  1.391739 -0.838139  0.226026
2014-03-31  1.471447 -0.987615  0.201999  1.228070
2014-03-31 -0.050524  0.539846  0.133359 -0.833252

最后，我要找的是图的叠加（每列一个），其中每个看起来如下（注意CI的不同值得到不同的alpha值）：

Answer 1

我不认为tsplot会使用您拥有的数据。它对输入数据的假设是您在每个时间点对相同的单位进行了采样（尽管某些单位可能缺少时间点）。

例如，假设您每天测量同一个人的血压一个月，然后您想按条件绘制平均血压（其中可能是＆＃34;条件＆＃34;变量是饮食他们在...上）。 tsplot可以执行此操作，调用看起来像sns.tsplot(df, time="day", unit="person", condition="diet", value="blood_pressure")

这种情况不同于在不同的饮食中有大群人，每天随机抽取每组的一些人并测量他们的血压。从您给出的示例来看，您的数据似乎就像这样。

但是，想出matplotlib和大熊猫的组合并不难，我会根据自己的想法做到这一点：

# Read in the data from the stackoverflow question
df = pd.read_clipboard().iloc[1:]

# Convert it to "long-form" or "tidy" representation
df = pd.melt(df, id_vars=["date"], var_name="condition")

# Plot the average value by condition and date
ax = df.groupby(["condition", "date"]).mean().unstack("condition").plot()

# Get a reference to the x-points corresponding to the dates and the the colors
x = np.arange(len(df.date.unique()))
palette = sns.color_palette()

# Calculate the 25th and 75th percentiles of the data
# and plot a translucent band between them
for cond, cond_df in df.groupby("condition"):
    low = cond_df.groupby("date").value.apply(np.percentile, 25)
    high = cond_df.groupby("date").value.apply(np.percentile, 75)
    ax.fill_between(x, low, high, alpha=.2, color=palette.pop(0))

此代码生成：