Question

我正在使用knitr从Rmd创建一个markdown文件，我在.Rmd脚本的顶部设置了以下选项来隐藏所有结果和图：

```{r, echo=FALSE}
opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide")
```

当我点击RStudio中的Knit HTML按钮时，这是有效的 - 我得到没有结果和数字的输出。但是，如果我从命令行运行：

Rscript -e 'knitr::knit("myfile.Rmd")'

似乎未读取opts_chunk$set()行，我在.md输出中得到结果和图。我通过在Rscript命令中指定这些选项解决了这个问题：

Rscript -e 'library(knitr); opts_chunk$set(results="hide", fig.show="hide"); knit("myfile.Rmd")'

但我宁愿保留从我正在使用的文件中读取的所有选项，而不是在命令行中指定。如何在命令行{{1}使用Rscript时获取.Rmd文件中读取的选项？

感谢。

Answer 1

我认为你需要添加

library("knitr")

到块（您可能希望在该块的块选项中设置message=FALSE）。

问题是当你做

时

Rscript -e 'knitr::knit("myfile.Rmd")'

你实际上没有附加knitr包，这意味着它不在函数的搜索路径中，这意味着R找不到opts_chunk对象。

单击RStudio中的按钮时，RStudio会自动在knitr运行的环境中加载knit()。