dplyr总结:等效“.drop = FALSE”以保持组输出长度为零

时间:2014-03-20 03:52:09

标签: r dplyr plyr tidyr

summariseplyr的{​​{1}}功能一起使用时,默认情况下会删除空类别。您可以通过添加ddply来更改此行为。但是,将.drop = FALSEsummarise一起使用时,这不起作用。还有另一种方法可以在结果中保留空类别吗?

以下是假数据的示例。

dplyr

不完全是我所希望的。是否有library(dplyr) df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6)) # Now add an extra level to df$b that has no corresponding value in df$a df$b = factor(df$b, levels=1:3) # Summarise with plyr, keeping categories with a count of zero plyr::ddply(df, "b", summarise, count_a=length(a), .drop=FALSE) b count_a 1 1 6 2 2 6 3 3 0 # Now try it with dplyr df %.% group_by(b) %.% summarise(count_a=length(a), .drop=FALSE) b count_a .drop 1 1 6 FALSE 2 2 6 FALSE 方法可以在dplyr中获得与.drop=FALSE相同的结果?

4 个答案:

答案 0 :(得分:56)

问题仍然存在,但与此同时,特别是因为您的数据已经考虑因素,您可以使用来自" tidyr"的complete。得到你可能想要的东西:

library(tidyr)
df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b)
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (int)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3      NA

如果您希望替换值为零,则需要使用fill指定:

df %>%
  group_by(b) %>%
  summarise(count_a=length(a)) %>%
  complete(b, fill = list(count_a = 0))
# Source: local data frame [3 x 2]
# 
#        b count_a
#   (fctr)   (dbl)
# 1      1       6
# 2      2       6
# 3      3       0

答案 1 :(得分:20)

dplyr解决方案:

首先制作分组df

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

然后我们通过使用n()

进行计数来总结那些发生的水平
res <- by_b %>% summarise( count_a = n() )

然后我们将结果合并到一个包含所有因子水平的数据框中:

expanded_res <- left_join(expand.grid(b = levels(df$b)),res)

最后,在这种情况下,因为我们查看计数,NA值会更改为0.

final_counts <- expanded_res[is.na(expanded_res)] <- 0

这也可以在功能上实现,请参阅答案: Add rows to grouped data with dplyr?

黑客攻击:

我想我会发布一个可怕的黑客,这种情况在这种情况下起作用是为了感兴趣。我严重怀疑你是否应该真的这样做,但它显示group_by()如何生成atrributes,好像df$b是一个字符向量而不是一个水平因素。另外,我并没有假装正确地理解这一点 - 但我希望这有助于我学习 - 这是我发布它的唯一原因!

by_b <- tbl_df(df) %>% group_by(b)

定义一个&#34;越界&#34;数据集中不存在的值。

oob_val <- nrow(by_b)+1

将属性修改为&#34;技巧&#34; summarise()

attr(by_b, "indices")[[3]] <- rep(NA,oob_val)
attr(by_b, "group_sizes")[3] <- 0
attr(by_b, "labels")[3,] <- 3

做总结:

res <- by_b %>% summarise(count_a = n())

索引并替换所有出现的oob_val

res[res == oob_val] <- 0

给出了预期的目的:

> res
Source: local data frame [3 x 2]

b count_a
1 1       6
2 2       6
3 3       0

答案 2 :(得分:11)

这不完全是问题中的问题,但至少对于这个简单的例子,你可以使用xtabs获得相同的结果,例如:

使用dplyr:

df %>%
  xtabs(formula = ~ b) %>%
  as.data.frame()

或更短:

as.data.frame(xtabs( ~ b, df))

结果(两种情况都相同):

  b Freq
1 1    6
2 2    6
3 3    0

答案 3 :(得分:7)

由于 dplyr 0.8 group_by获得了.drop参数,该参数完全符合您的要求:

df = data.frame(a=rep(1:3,4), b=rep(1:2,6))
df$b = factor(df$b, levels=1:3)

df %>%
  group_by(b, .drop=FALSE) %>%
  summarise(count_a=length(a))

#> # A tibble: 3 x 2
#>   b     count_a
#>   <fct>   <int>
#> 1 1           6
#> 2 2           6
#> 3 3           0

与@Moody_Mudskipper的答案一起提供的另一条注释:如果一个或多个分组变量未编码为因素,则使用.drop=FALSE可能会产生意外结果。请参阅以下示例:

library(dplyr)
data(iris)

# Add an additional level to Species
iris$Species = factor(iris$Species, levels=c(levels(iris$Species), "empty_level"))

# Species is a factor and empty groups are included in the output
iris %>% group_by(Species, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species         n
#> 1 setosa         50
#> 2 versicolor     50
#> 3 virginica      50
#> 4 empty_level     0

# Add character column
iris$group2 = c(rep(c("A","B"), 50), rep(c("B","C"), each=25))

# Empty groups involving combinations of Species and group2 are not included in output
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>   Species     group2     n
#> 1 setosa      A         25
#> 2 setosa      B         25
#> 3 versicolor  A         25
#> 4 versicolor  B         25
#> 5 virginica   B         25
#> 6 virginica   C         25
#> 7 empty_level <NA>       0

# Turn group2 into a factor
iris$group2 = factor(iris$group2)

# Now all possible combinations of Species and group2 are included in the output, 
#  whether present in the data or not
iris %>% group_by(Species, group2, .drop=FALSE) %>% tally

#>    Species     group2     n
#>  1 setosa      A         25
#>  2 setosa      B         25
#>  3 setosa      C          0
#>  4 versicolor  A         25
#>  5 versicolor  B         25
#>  6 versicolor  C          0
#>  7 virginica   A          0
#>  8 virginica   B         25
#>  9 virginica   C         25
#> 10 empty_level A          0
#> 11 empty_level B          0
#> 12 empty_level C          0

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