使用alpha值显示“热图”图像 - Matplotlib / Python

时间:2014-03-17 13:30:04

标签: python matplotlib rgba colorbar imshow

我试图绘制一些数据来分析它们。

我的数据定义如下:

class Data(object):
    def __init__(self, rows=200, cols=300):
        """
        The Data constructor
        """
        # The data grid
        self.cols = cols
        self.rows = rows
        # The 2D data structure
        self.data = numpy.zeros((rows, cols), float)

起初,我有这个方法:

  def generate_data_heat_map(data, x_axis_label, y_axis_label, plot_title, file_path):
    plt.figure()
    plt.title(plot_title)
    fig = plt.imshow(data.data, extent=[0, data.cols, data.rows, 0])
    plt.xlabel(x_axis_label)
    plt.ylabel(y_axis_label)
    plt.colorbar(fig)
    plt.savefig(file_path + '.png')
    plt.close()

这给了我一些热图图像(第二张图),因为我传递给它一个MxN [亮度(灰度,仅浮点数组)]。并且不知道为什么这不能生成灰度图像,但到目前为止我并不担心它,因为这是我想要的结果。

经过一些计算后,我使用 data_property 作为RGB并使用 data_uncertaity 作为alpha来显示我的数据:

def generate_data_uncertainty_heat_map(data_property, data_uncertainty, x_axis_label, y_axis_label, plot_title, file_path):
    plt.figure()
    uncertainty = numpy.zeros((data_property.rows, data_property.cols, 4))
    uncertainty[..., :3] = data_property.data[..., numpy.newaxis]
    uncertainty[..., 3] = data_uncertainty.data
    plt.title(plot_title)
    fig = plt.imshow(uncertainty.data, extent=[0, data_property.cols, data_property.rows, 0])
    plt.xlabel(x_axis_label)
    plt.ylabel(y_axis_label)
    plt.colorbar(fig)
    plt.savefig(file_path + '.png')
    plt.close()

但是,当然,这给了我一个带有alpha值的灰度图像,因为我重复了R,G和B的相同值。但我真正想要的是第一个方法结果(有色)和一些alpha值计算为数据的不确定性。

enter image description here

我注意到我的颜色条也没有关于我的数据(它是RGB的,我不能用它来分析我的数据)

我不知道如何实现我想要的结果,这就是拥有一张热图"绘制合并了用我的 uncertainty_data 定义的alpha值和表示这种不确定性的颜色条。就像合并上面两张图片一样:

这是我的颜色: Figure 2

这是我的alpha: enter image description here

随着@BlazBratanic提供的转换,我想我可以看到一点颜色(不确定),但它远远超出了我的预期。

enter image description here

我的所有值都介于0.0和1.0之间。

提前谢谢。

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

使用Matplotlib cm module将灰度映射到颜色值。如果我没记错,“jet”是默认的色彩映射。所以你会做类似的事情:

uncertainty = plt.cm.jet(data_property.data)
uncertainty[..., 3] = data_uncertainty.data