Question

我有一个大的igraph对象，它有几个边缘和顶点属性，我需要写入文件并稍后再次加载（可能是通过不同的程序，如python）。

> g
IGRAPH DN-- 85000 1000000 -- 
+ attr: name (v/c), numeric_var (e/n), binary_outcome1 (e/x), binary_outcome2 (e/x)

那么我应该使用什么格式将所有边缘属性写入文件格式？

write.graph(g, file = "test1.fileextension",format = "which_format?")

非常感谢！

Answer 1

专业人士R igraph read.igraph帮助文件http://igraph.sourceforge.net/doc/R/read.graph.html中很好地记录了各种支持格式的缺点。 write.igraph页面显示支持更多类型的输出

Edge List太简单了，无法满足您的需求
Pajek可能过于特定于域名，并且对GraphML
Dot可能能够满足您的需求（参考：http://www.graphviz.org/Documentation/dotguide.pdf）
GraphML不会处理超图，嵌套图或混合（有向/无向）图。
GML表示“只使用节点和边缘属性，并且只有它们具有简单类型：整数，实数或字符串。因此，如果属性是数组或记录，则忽略它。如果只有属性的某些值很复杂，情况也是如此。“
DL是不会为你工作的。
NCOL“只是一个象征性的加权边缘列表”，所以它也很明显。
LGL也太简单了。
DIMACS没有您需要的额外信息。
LEDA（我相信）只支持单一属性。
GraphDB也有局限性。

所以，我要给GraphML和GML一个。