R实验设计:平衡不完全块设计

时间:2014-03-11 13:25:33

标签: r matlab latin-square experimental-design

我想生成一个矩阵来计划实验。

  • 我在6天内有6个人和6个治疗。
  • 我每周可以使用1个人(6天6天总共= 36天的测试,每天6次治疗)。
  • 每天,我会以随机顺序对个体进行6次治疗。 个人不应该在一周中的任何一天开始使用相同的治疗方法。

例如:

Monday: A C D B E F
Tuesday: C E A B F D
...
  • 如果可能,不同的人不应该与其他人订购相同的订单。
  • 我想考虑订单处理;也就是说,每对治疗之后应尽可能多地重复,以避免“遗留”(序列和顺序)效应。 我目前正与R合作,但也可以使用MATLAB。

我试图使用“agricolae”包和“crossdes”包来设计一个设计但到目前为止没有成功。我的想法是使用平衡的不完整块设计。我的一个代码示例如下。

> trt <- c("A", "B", "C", "D", "E", "F" )
> k <- 6
> outdesign<- design.bib (trt, k, seed=0)
Error in md[i, bi] : incorrect number of dimensions

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

您使用了错误的功能。你想要一个完整的块设计(design.rcbd),而不是一个不完整的块设计。不完整的块设计将创建块,其中仅包括一些处理。因此,对于design.bib,k

编辑:这将为您提供6个科目6天。强迫每一天开始对每个受试者采取不同的治疗方法比我现在有时间更多,但也许其他人会在我到达之前回答你。

trt <- c("A", "B", "C", "D", "E", "F" )
N <- 6
days <- 6

outdesign<-as.data.frame(matrix(nrow=N*length(trt),ncol=days+1))
names(outdesign)<-c("Subj", "Day1", "Day2", "Day3", "Day4", "Day5", "Day6")
outdesign$Subj<-rep(1:6,each=length(trt))
for (i in 1:days) {
  outdesign[,i+1]<- design.rcbd(trt, N, seed=0,first=TRUE)$book$trt
}

   Subj Day1 Day2 Day3 Day4 Day5 Day6
1     1    E    F    D    C    C    C
2     1    C    E    E    F    F    E
3     1    D    C    B    A    E    D
4     1    B    D    F    D    A    A
5     1    A    B    C    B    D    F
6     1    F    A    A    E    B    B
7     2    D    C    F    A    F    F
8     2    B    E    B    C    E    B
9     2    C    D    E    E    D    A
10    2    A    F    A    F    B    E
11    2    F    A    D    B    C    D
12    2    E    B    C    D    A    C
13    3    B    C    C    A    B    F
14    3    A    A    E    F    E    E
15    3    C    E    F    B    A    B
16    3    E    B    A    C    F    A
17    3    F    F    B    D    C    C
18    3    D    D    D    E    D    D
19    4    F    C    F    D    F    E
20    4    D    B    A    E    B    D
21    4    B    F    D    A    A    F
22    4    C    A    B    B    D    B
23    4    E    E    E    C    C    C
24    4    A    D    C    F    E    A
25    5    D    E    F    A    A    F
26    5    A    D    E    E    E    B
27    5    C    C    C    D    D    E
28    5    E    F    B    C    C    C
29    5    B    A    A    F    B    A
30    5    F    B    D    B    F    D
31    6    F    F    A    F    C    F
32    6    A    D    E    E    D    B
33    6    C    B    C    D    A    A
34    6    B    C    F    C    F    C
35    6    E    E    B    A    E    D
36    6    D    A    D    B    B    E