mixOmics软件包用于分析大数据集(例如来自高吞吐量实验),但似乎无法使用我的大矩阵。
我遇到了rcc(正则化规范相关)和tune.rcc(正则化参数的labmda参数估计)的问题。
> str(Y)
num [1:13, 1:17766] ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : chr [1:13] ...
..$ : chr [1:17766] ...
> str(X)
num [1:13, 1:26] ...
- attr(*, "dimnames")=List of 2
..$ : chr [1:13] ...
..$ : chr [1:26] ...
tune.rcc(X, Y, grid1 = seq(0.001, 1, length = 5),
grid2 = seq(0.001, 1, length = 5),
validation = "loo", plt=F)
On Mavericks:永远奔跑(我在下班后退出R)
因为我知道Mavericks存在问题,所以我在Windows8机器和mixOmics网络界面上尝试过它。
在Windows 8上:
Error: cannot allocate vector of size 2.4 Gb
在网络界面上,由于无法估计lambdas(tune.rcc),我尝试使用“some”lambdas rcc
并获取:
Error: cannot allocate vector of size 2.4 Gb
我做错了什么吗? 非常感谢任何帮助。