PyMOL:获取选择序列

时间:2014-03-03 09:35:36

标签: alignment pymol

我已经选择了这样的残留物:

fetch 1bsx
select interface_1bsx, byres((1bs and chain A) within 5A of (1bsx and chain X)) 

如何获得interface_1bsx的序列?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

使用iterate命令(pymol wiki):

iterate interface_1bsx, resn

或者如果您希望将它放在python列表中:

residues = []
iterate interface_1bsx, residues.append(resn)
print(residues)