如何在远程服务器上轻松执行R命令？

Question

我在Windows上使用Excel + R在一个相当慢的桌面上。我有一个完全的管理员访问非常快速的基于Ubuntu的服务器。我想知道：如何在服务器上远程执行命令？

我可以做的是使用saveRDS保存所需的变量，并使用loadRDS将它们加载到服务器上，在服务器上执行命令，然后保存结果并将其加载到Windows上。< / p>

但它非常具有互动性和手动性，很难定期完成。

有没有办法直接从R做这些东西，比如

1. 通过以下方式与服务器连接SSH，
2. 传输所需的对象（可以手动指定）
3. 在服务器上执行给定代码并等待结果
4. 获得结果。

我可以远程运行整个R，但随后它会产生与网络相关的问题。我在Excel中执行的大多数R命令都非常快且数据量很大。我只需要远程执行一些特定的命令，而不是所有命令。

Answer 1

这是我的设置。

1. 使用scp复制代码和数据。 （我使用github，所以我从github克隆我的代码。这有利于确保我的工作可以重现）

2. （可选）使用sshfs在本地计算机上安装远程文件夹。这允许您使用本地文本编辑器而不是ssh命令行编辑远程文件。

3. 将您要运行的所有内容放在R脚本中（在远程服务器上），然后在R批处理模式下通过ssh运行它。

Answer 2

有几个选项，最简单的是交换安全密钥以避免一直手动输入SSH / SCP密码。在此之后，您可以编写一个简单的R脚本：

1. 将必要的变量保存到数据文件中
2. 使用scp将数据文件上传到ubuntu服务器
3. 使用ssh运行远程脚本，该脚本将处理数据（您刚刚上传的数据）并将结果存储在另一个数据文件中
4. 再次使用scp命令将结果传回工作站。

您可以使用R的system命令运行带有必要选项的scp和ssh。

另一个选项是在远程计算机上设置集群工作程序，然后您可以使用clusterExport导出数据并使用clusterEvalQ和clusterApply计算表达式。

Answer 3

还有一些选择： 1）您可以使用Rserve直接从R完成这些操作。请参阅：https://rforge.net/

请记住，Rserve可以接受来自R客户端的连接，例如参见how to connect to Rserve with an R client。

2）您可以在Linux机器上设置群集，然后从Windows客户端使用这些群集功能。最简单的是使用Snow，https://cran.r-project.org/package=snow，也可以看到foreach和许多其他集群库。