Question

我很困惑。我已经完成了这个过程十几次，从来没有遇到过这个问题。

我为Ubuntu安装了最新版本的R

我输入R，没有任何问题，给我最新版本，我可以加载原生包。

但是当我尝试安装新软件包时，他们会下载，但我什么都没得到。例如，如果我安装ggplot2：

> install.packages("ggplot2")
Installing package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependencies ‘colorspace’, ‘stringr’, ‘RColorBrewer’, ‘dichromat’, ‘munsell’, ‘labeling’, ‘plyr’, ‘digest’, ‘gtable’, ‘reshape2’, ‘scales’, ‘proto’

trying URL 'http://rweb.quant.ku.edu/cran/src/contrib/colorspace_1.2-4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 242791 bytes (237 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 237 Kb

trying URL 'http://rweb.quant.ku.edu/cran/src/contrib/stringr_0.6.2.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 20636 bytes (20 Kb)
opened URL
==================================================
downloaded 20 Kb

[snip ... ]

trying URL 'http://rweb.quant.ku.edu/cran/src/contrib/ggplot2_0.9.3.1.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 2330942 bytes (2.2 Mb)
opened URL
==================================================
downloaded 2.2 Mb


The downloaded source packages are in
        ‘/tmp/RtmpoPUAFL/downloaded_packages’
> library(ggplot2)
Error in library(ggplot2) : there is no package called ‘ggplot2’

我已经完全清除过多次文件，但没有运气。

我以root身份登录。

我觉得我错过了一些明显的东西？我不知道 - 我在Ubuntu，Mac，Windows和Debian上做了十几次同样的事情。帮助

Answer 1

@jdharrison帮了忙。问题是我正在运行的VPS上的内存不足，所以我添加了一些交换，如下所述：

How do you add swap to an EC2 instance?

Answer 2

看看最后几行：

The downloaded source packages are in
    ‘/tmp/RtmpoPUAFL/downloaded_packages’

你必须转到目录/tmp/RtmpoPUAFL/downloaded_packages（cd ...）然后按照上面指出的顺序手动安装它们。所以

R CMD INSTALL colorspace_1.2-4.tar.gz
R CMD INSTALL stringr_0.6.2.tar.gz
R CMD INSTALL ggplot2_0.9.3.1.tar.gz

然后尝试library(ggplot2)现在应该可以使用

我不知道为什么你有时必须这样做...我知道我也很乐意学习它。

Answer 3

如果您的服务器没有足够的RAM，则R无法安装软件包。

解决方案是增加物理内存，或者增加交换文件的大小。

创建一个2 gig交换文件

sudo fallocate -l 2G /swap.img
sudo mkswap /swap.img
sudo swapon /swap.img

您可以使用swapon命令

查看可用的免费交换量

root@foo:# swapon -s
Filename                Type        Size    Used    Priority
/swap.img                               file        2097148 213388  -1

install.packages R在Ubuntu 12.04下载，但不安装包

3 个答案: