R中的Gillespies SSA算法

时间:2014-02-17 11:44:12

标签: r stochastic

有人知道R中Gillespie SSA的语法吗?我发现的代码是:

input n=#iterations,r=#reactions,h=step size (dt)
input x(0) =initial conditions,v=state shift matrix
t←0 
for i= 1 to n
   for j= 1 to r
       p←uniform random number in [0,1]
       If
       p < a(x)h then x(t+h)←x(t)+vj
   end
   t←t+h
end

我需要帮助SSA的这个或新的简单布局

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