Question

假设我有一个数据帧，其中2个变量对应于为不同的A，B和C组计算的2个指数。所以数据框基本上是：

 >df
   Group      v.1      v.2
     A         2        3
     B         4        4
     C         7        9

我想计算每个变量（v.1＆amp; v.2）的成对差异，然后以交叉制表格式绘制结果，因此对角线以下的值给出了对v.1和上对角线的差异，v.2中成对差异的值。结果如下：

        A       B       C 
   A    0       1       6
   B    2       0       5
   C    5       3       0

是否有任何包可以帮助我实现这一目标？任何建议都会受到欢迎。

Answer 1

您可以使用combn + diff以及upper.tri和lower.tri，如下所示：

m <- matrix(0, nrow = nrow(df), ncol = nrow(df), 
            dimnames=list(df$Group, df$Group))
m
#   A B C
# A 0 0 0
# B 0 0 0
# C 0 0 0

m[lower.tri(m)] <- combn(df$v.1, 2, FUN=diff)
m[upper.tri(m)] <- combn(df$v.2, 2, FUN=diff)
m
#   A B C
# A 0 1 6
# B 2 0 5
# C 5 3 0

Answer 2

不像@ A5C1D2H2I1M1N2O1R2T1的解决方案那么顺利，但是也可以使用来自R outer包的base函数来解决这个问题：

df <- read.table(text =
                   "Group      v.1      v.2
                      A         2        3
                      B         4        4
                      C         7        9",
                 header = TRUE)

# matrix of pairwise differences for v.1
mat_dif1 <- outer(X = df$v.1, Y = df$v.1, FUN = "-")
mat_dif1[mat_dif1<0] <- 0

# matrix of pairwise differences for v.2
mat_dif2 <- outer(X = df$v.2, Y = df$v.2, FUN = "-")
mat_dif2[mat_dif2>0] <- 0

mat_dif1 + abs(mat_dif2)

##      [,1] [,2] [,3]
## [1,]    0    1    6
## [2,]    2    0    5
## [3,]    5    3    0

如果您需要行名和列名，则：

results <- mat_dif1 + abs(mat_dif2)
dimnames(results) <- list(df$Group, df$Group)
results
##   A B C
## A 0 1 6
## B 2 0 5
## C 5 3 0

成对差异的交叉制表

2 个答案: