Question

我使用geepack的广义估计方程运行线性回归模型。 confint(fit)命令在这里似乎不起作用。例如：

f2 <- geeglm(FEV1 ~ Age, data = Hospdata, family=gaussian, id=HHID)  
summary(f2)
confint(f2)

我在运行confint(f2)时收到以下错误消息：

> confint(f2)
Waiting for profiling to be done...
Error in `[.data.frame`(summ$coefficients, , "Std. Error", drop = FALSE) : undefined columns selected

有没有办法在这里找到置信区间？

Answer 1

这样的事情：

library(geepack)
data(dietox)
dietox$Cu     <- as.factor(dietox$Cu)
mf1 <- formula(Weight~Cu*poly(Time,3))
gee1 <- geeglm(mf1, data=dietox, id=Pig,
               family=poisson("identity"),corstr="ar1")
cc <- coef(summary(gee1))
citab <- with(as.data.frame(cc),
     cbind(lwr=Estimate-1.96*Std.err,
           upr=Estimate+1.96*Std.err))
rownames(citab) <- rownames(cc)

为方便起见，您可以编写一个confint方法来封装它：

confint.geeglm <- function(object, parm, level = 0.95, ...) {
    cc <- coef(summary(object))
    mult <- qnorm((1+level)/2)
    citab <- with(as.data.frame(cc),
                  cbind(lwr=Estimate-mult*Std.err,
                        upr=Estimate+mult*Std.err))
    rownames(citab) <- rownames(cc)
    citab[parm,]
}

confint(gee1)

Answer 2

confint来自stats包。 geeglm来自geepack包。

您需要确定模型输出中存储置信区间的位置。

使用str(f2)或从summary(f2)派生。

另请查看f2$和标签，以便通过模型对象自动完成。

另外，请参阅文档 - link。您可能必须构建自己的模型，因为我运行的示例模型没有生成CI。您可能必须从参数标准错误中手动滚动它们。

Answer 3

我使用了 Ben 的回复，但也发现此方法有效：broom:tidy(f2, conf.int = TRUE)

使用广义估计方程（GEE）的系数置信区间

3 个答案: