将随机样本分配给多边形

时间:2014-01-16 19:57:52

标签: r spatial shapefile random-sample

我正在尝试编写随机分配例程的脚本。采样设计的区域分为多个多边形或多层。一组但不同数量的样本将被随机分配给每个层(最少2个样本,但在某些层中多达7个)。因此,我有一个分层的shapefile,在它的'属性表中,分层名称和每个所需的样本数。

  • STRATA;样品
  • 440; 4
  • 441; 2
  • 5Z3; 4
  • 5Z1; 7
  • 560; 2

我在这些类型的抽样设计(http://casoilresource.lawr.ucdavis.edu/drupal/book/export/html/519)上找到了一些很好的文档,尽管我在根据自己的需要实施例程时遇到了一些问题。在此链接之后,我一直在使用rgdal和maptools包。我的工作脚本如下:

# read in strata boundary shapefile 
strataboundaries <- readOGR('strataboundaries.shp', layer='strataboundaries')
#sample allocation to strata
allocation <- sapply(slot(strataboundaries, 'polygons'), function(i) spsample(i, n=4, type='random'))
allocation.merge <- do.call('rbind', allocation)
stratumID <- sapply(slot(strataboundaries, 'polygons'), function(i) slot(i, 'ID'))
sample <- sapply(allocation, function(i) nrow(i@coords))
sampleID <- rep(stratumID, sample)
allocation.final <- SpatialPointsDataFrame(allocation.merge, 
data=data.frame(poly_id=sampleID))
plot(strataboundaries, col="lightcyan", bborder="black", axes=TRUE, bg="lightsteelblue1")
points(allocation.final, col="red", pch=3, cex=0.8)
#write out shapefile containing sampling locations
allocation.final@proj4string <- strataboundaries@proj4string
writeOGR(allocation.final, ".", "allocation", driver='ESRI Shapefile')

然而,每层的采样强度不是静态的(我有n = 4)。我需要这个来反映属性表中的列,它表示给定层所需的样本数量。我还想将分层名称分配回已分配的采样位置。

理想情况下,例程将迭代每个多边形并随机分配n个样本(如属性表中所示)并写为shapefile。任何方向将不胜感激。我对这个项目比较陌生,所以如果我错过了一些明显的东西,我会道歉。

[1] "SpatialPolygonsDataFrame"
attr(,"package")
[1] "sp"

Formal class 'SpatialPolygonsDataFrame' [package "sp"] with 5 slots
  ..@ data       :'data.frame': 66 obs. of  3 variables:
  .. ..$ OBJECTID_1: int [1:66] 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 ...
  .. ..$ Stratum1  : Factor w/ 66 levels "440","441","442",..: 65 64 63 62 61 60 12 11 7 49 ...
  .. ..$ Primary   : int [1:66] 2 2 4 5 2 7 2 2 2 2 ...
  ..@ polygons   :List of 66
  .. ..$ :Formal class 'Polygons' [package "sp"] with 5 slots
  .. .. .. ..@ Polygons :List of 1
  .. .. .. .. ..$ :Formal class 'Polygon' [package "sp"] with 5 slots
  .. .. .. .. .. .. ..@ labpt  : num [1:2] -68.3 40.4
  .. .. .. .. .. .. ..@ area   : num 0.769
  .. .. .. .. .. .. ..@ hole   : logi FALSE
  .. .. .. .. .. .. ..@ ringDir: int 1
  .. .. .. .. .. .. ..@ coords : num [1:654, 1:2] -66.3 -66.3 -66.4 -66.4 -66.4 ...
  .. .. .. ..@ plotOrder: int 1
  .. .. .. ..@ labpt    : num [1:2] -68.3 40.4
  .. .. .. ..@ ID       : chr "0"
  .. .. .. ..@ area     : num 0.769

1 个答案:

答案 0 :(得分:0)

不幸的是,我无法帮助您在不打开shapefile的情况下进行适当的采样。但是,让我给你一些建议,这可能会有所帮助:

  1. 如果点数变化并且不像您提到的那样是静态的 因此,巧妙地使用for循环,这将有所帮助 distingush每次分布在特定多边形区域上的点数。
  2. SpatialPolygons - 对象的构造比第一个多边形要小 将在“ x @ polygons [[i]] @Polygons [[1]] ”下找到 i = 1 是第一个多边形, i = 2 是第二个多边形,依此类推 i = n 是你的第n个多边形, x 是你的SpatialPolygonsDataFrame。
  3. 希望我能帮助你更进一步。