Heatmap.2控制R中的轴

Question

我正在使用gplots库中的heatmap.2函数来绘制热图。我设法创建了热图，但关于轴的问题很少。我希望热图只显示轴的选定值。请参考下面附带的热图图像。我想知道如何在X轴上显示X76.100，X176.200，X276.300等点，在Y轴上显示Y76.100，Y176.200，Y276.300等点，同时隐藏其他点轴。

如果问题需要进一步澄清，请告诉我。

到目前为止我使用过的代码：

   library(gplots)     
   file=read.table("Heatfile25.txt", sep="\t", header=TRUE, row.names=1)
   file[is.na(file)]<-0
   data_matrix<-as.matrix(file)
   heatmap.2(data_matrix, scale="none",dendrogram="none", col=grey(seq(1,0,-0.01)),      
     trace="none", Rowv=NA, Colv=NA, main="PB2 VS PB1")

感谢

Answer 1

通过从matrix转到data.frame输入数据，您可以轻松使用过滤语句来选择相关的行和列。让DF成为您的data.frame：

columnKeeps <- c("X76.100", "X176.200", "X276.300")
DFfiltered <- DF[,(names(DF) %in% columnKeeps)]

rowKeeps <- c("Y76.100", "Y176.200", "Y276.300")
DFfiltered <- DFfiltered [(rownames(DFfiltered) %in% rowKeeps),]

现在无法测试，所以我可能已经交换了列和行但你应该管理：）

有关详细信息，请参阅Drop data frame columns by name