我正在开发一个R包，pk。我已成功安装并使用它，现在我正在尝试使用run_examples包中的devtools函数清理示例。但是，它在第一个例子中崩溃了：
> require(pk)
> require(devtools)
> run_examples("~/[full path]/pk")
Updating pk documentation
Running 45 example files in pk
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Loading pk
Running examples in pk-package.Rd
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1> ########################################################################
1> ## Simulate a dataset ... blah blah
1> set.seed(1)
1> x = my_pk_fun(a = 1)
Error in eval(expr, envir, enclos) : could not find function "my_pk_fun"
Loading pk
由于我已经加载了我的包（使用require），我还需要做些什么才能使my_pk_fun对run_examples可见？我已经检查过我的R会话中确实存在my_pk_fun。
更新
在Dirk的评论之后，我检查了我的命名空间文件，发现它完全是空的。正如documentation所建议的那样（虽然不推荐），我插入了exportPattern("^[^\\.]")，它似乎应该导出所有函数，包括my_pk_fun。但是，在重复上述实验后，（a）我得到相同的错误，并且（b）删除了命名空间文件的内容！为什么run_examples清空我的命名空间文件？
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我猜想解决了我自己的问题：
我省略的一个细节是，在我让run_examples完成任何事情之前，它要求我首先安装roxygen2包（尽管roxygen2仅在下面列出＆＃34;在devtools文档中建议＆＃34;。
在挖掘run_examples的源代码时，我确实找到了roxygenize的一些用法。已经previously noted对包进行漫游可以起到重写NAMESPACE文件的作用。
明确地说，run_examples清空我的NAMESPACE文件的原因是（1）run_examples为我的包充分氧化，而（2）我从未包含任何# @export命令（或者我的源文件中的任何其他roxygen2-speak）。
结论：除非您在roxygen2框架内构建软件包，并在源代码中包含所有.Rd文档作为注释，否则请勿使用run_examples！似乎应该在run_examples文档中对此进行警告。
出路：如果您真的必须使用run_examples，并且您愿意稍微了解roxygen，这实际上非常酷，然后开始here。