改变热图的布局。图

Question

我们使用heatmap.2来绘制数字。使用默认参数，我们可以获得以下布局/展望（参见图1）。

1. 如何删除正确的行名称/行标签，因为我们有数千个标签（参见图1）？

2. 我们可以向上向下绘制颜色键（参见图2）吗？

图1



图2

Answer 1

问题1：可以通过设置labRow = ""来删除行名称。

问题2：如果不改变功能，这是不可能的。 heatmap.2使用2 x 2表作为布局，如果要添加一个键，则将键放在左上角的单元格中。您需要编辑该功能以使其具有2×3布局，并将该键放在右下方的单元格中，编辑显示以显示所示。

Answer 2

问题2. Ian对heatmap.2组件的布局给出了很好的解释。您可以更改布局（表中每个元素“绘制”的单元格数，例如2x2,2x3,3x2,3x3）以及热图的每个元素的位置（即热图，行树形图，列树形图，和关键）。

例如：

# Define custom layout for heatmap
mylmat = rbind(c(0,3,0),c(2,1,0),c(0,4,0)) # creates 3x3 table with location of heatmap elements defined
mylwid = c(1.5,4,0.5)
mylhei = c(1.5,4,1)

# Plot your heatmap
heatmap.2(matrix.name, lmat=mylmat, lwid=mylwid, lhei=mylhei, ...)

虽然您无法将键更改为垂直键与水平键（据我所知！），您可以将其放置在热图和/或树形图周围的任何位置。