Question

我有这个巨大的维度数据。

A尺寸（50,12000）和B尺寸（50,1000）。

我想计算A的每一列与B的每一列的相关性。如何有效地进行此操作

我在matlab中尝试使用corr([A B])，但它消耗了大量内存并冻结。如何快速有效地完成这项工作？

Answer 1

要计算A的每列与每个B列的相关性，请使用corr(A,B)，而不是corr([A B])。

如果corr(A,B)导致内存问题，请以块的形式工作。例如，以下代码将A划分为chunk_size列的垂直条带，计算每个A - 条带与B的相关性，并存储它。最终结果与corr(A,B)相同。

chunk_size = 100; %// must divide size(A,2) (easy to avoid if needed, though)
result = NaN(size(A,2),size(B,2)); %// preallocate
for ii = chunk_size:chunk_size:size(A,2)
    ind = ii+(-chunk_size+1:0);
    result(ind,:) = corr(A(:,ind),B);
end

有效地计算相关系数

1 个答案: