我有一个非常大的Scipy稀疏矩阵(CSR_MATRIX)。我只想知道如何计算每一行的值之和以及矩阵每列的值之和。
我有一个代码执行相同的操作,但它使用的是CSC_MATRIX。关于对行和列进行求和,这两者之间有什么不同吗?
我想也许我可以得到其他人也可以使用的快速回复,否则我可以自己测试一下。
from scipy.sparse import *
from scipy import *
row = array([0,0,1,2,2,2])
col = array([0,2,2,0,1,2])
data = array([1,2,3,4,5,6])
csr_matrix( (data,(row,col)), shape=(3,3) ).todense()
rowsums = []
colsums = []
#compute rowsums and colsums
所以rowsums
应为[3, 3, 15]
而colsum
应为[5, 5, 11]
。
我知道我可以使用matrix.getrow(i)和matrix.getcol(i)来获取每一行和列,并使用sum()函数来获得总和,但我关注的是性能。我需要一个更有效的解决方案。
答案 0 :(得分:10)
使用axis
方法的sum
参数:
In [2]: row = array([0,0,1,2,2,2])
In [3]: col = array([0,2,2,0,1,2])
In [4]: data = array([1,2,3,4,5,6])
In [5]: a = csr_matrix((data, (row, col)), shape=(3,3))
In [6]: a.A
Out[6]:
array([[1, 0, 2],
[0, 0, 3],
[4, 5, 6]])
In [7]: a.sum(axis=0) # sum the columns
Out[7]: matrix([[ 5, 5, 11]])
In [8]: a.sum(axis=1) # sum the rows
Out[8]:
matrix([[ 3],
[ 3],
[15]])