具有标量(非向量)返回值的S4方法

时间:2013-11-07 22:18:30

标签: r s4

我想定义一个返回标量返回值的S4方法。这里我的意思是标量值,与矢量相反。

setGeneric("getScalar", function(value,  ...) 
  standardGeneric("getScalar")
)
setMethod("getScalar", 
          signature(value = "ANY"),
          def = function(value, ...) getScalar(value,...), ## call external function
          valueClass = "atomic" ### atomic is false, what should I do ?
)

我不能通过它的输出覆盖方法,我的意思是我不能定义许多具有相同签名的函数,返回valueClass:numeric,integer,character,.. 那我该怎么做呢?

编辑以提供更多背景信息:

我认为原子在这里令人困惑。我的意思是通过标量数字值或布尔或字符,长度为1。为了给出更多的上下文,我的包中将有3个函数:

dbGetQuery   :return a list/data.frame : i.e some table rows
dbGetScalar  :return a scalar value  : i.e count(*),table_name,..
dbGetNoQuery :return nothing          : update/insert actions

它是DBI接口的扩展。

EDIT2

我们可以假设标量是长度为1的向量。但我不能用S4表达这个条件。在c#或c中,我会写

double[]       // vector
double        // scalar

也许我应该改变我的功能名称。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

一种可能性是在方法调度后检查返回类型的值

setGeneric("getScalar", function(x, ...) {
    value <- standardGeneric("getScalar")
    if (!is.atomic(value) || length(value) != 1L)
        stop("not a scalar atomic vector")
    value
})

setMethod(getScalar, "ANY", function(x, ...) x)

另一种可能性是定义一个&#39; Scalar&#39; class,对强制执行约束的基类进行有效性检查

.Scalar <- setClass("Scalar", contains="ANY", validity=function(object) {
    if (length(object) != 1L)
        "non-scalar object"
    else TRUE
}, prototype=NA)

或使用基于虚拟类的小层次结构更强烈地控制标量类型

setClass("Scalar", validity=function(object) {
    if (length(object) != 1L)
        "non-scalar object"
    else TRUE
})

.ScalarInteger <- setClass("ScalarInteger",
    contains=c("Scalar", "integer"),
    prototype=prototype(NA_integer_))

这是BioconductorBiobase包中采用mkScalar构造函数的方法。