f2py与fortran netcdf

时间:2013-10-31 15:56:58

标签: python fortran netcdf f2py

我正在尝试使用f2py编译一些使用netcdf库的fortran代码。编译似乎工作,但当我尝试在python中导入模块时,我收到错误消息:

Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
ImportError: ./cdfio_simple.so: undefined symbol: netcdf_mp_nf90_get_var_2d_fourbytereal_

编译期间还有以下输出:

In: :cdfio_simple:cdfio_simple.f90:cdfio_simple
get_useparameters: no module netcdf info used by cdfio_simple

我尝试使用的代码是(注意这是用于演示问题的简化代码):

MODULE cdfio_simple
 USE netcdf 

  PRIVATE
  PUBLIC  getvar

CONTAINS
  FUNCTION  getvar (cdfile,cdvar)

    CHARACTER(LEN=*), INTENT(in) :: cdfile,     &   ! file name
         &                          cdvar           ! variable 
    REAL(KIND=4), DIMENSION(1442,1021) :: getvar      ! 2D REAL

    !! * Local variables
    INTEGER :: ncid, id_var
    INTEGER :: istatus 
    CHARACTER(LEN=300) :: clvar

!f2py INTENT(in):: cdfile, cdvar

    clvar=cdvar

    istatus=NF90_OPEN(cdfile,NF90_NOWRITE,ncid) 

    istatus=NF90_INQUIRE(ncid,unlimitedDimId=id_dimunlim)
    istatus=NF90_INQ_VARID ( ncid,clvar,id_var)
    istatus=NF90_GET_VAR(ncid,id_var,getvar)

    istatus=NF90_CLOSE(ncid)
    getvar(:,:)=1

  END FUNCTION getvar

END MODULE cdfio_simple

要编译它我使用命令:

f2py --fcompiler=intelem -c -I/usr/local/netcdf/include/ -L/usr/local/netcdf/lib -lnetcdff --f90flags=-fPIC -m cdfio_simple cdfio_simple.f90

有谁知道如何让它正常工作?提前感谢任何建议。

1 个答案:

答案 0 :(得分:3)

&#34; no module netcdf&#34;来自编译器的错误消息可能是 表明存在以下任一问题:

  • 没有安装netcdf.mod模块文件 / usr / local / netcdf / include /,它应该有的地方 已安装为安装的一部分 netcdf-fortran软件

  • 您使用的Fortran编译器与以前不同 创建安装在该目录中的netcdf.mod模块文件。 不同的Fortran编译器有不同的格式 二进制.mod文件。