使用矩阵结构加速matlab

时间:2013-10-21 21:05:41

标签: performance matlab matrix-multiplication

假设我有一个N-by-K矩阵AN-by-P矩阵B。我想进行以下计算,以获得最终的N-by-P矩阵X

X(n,p) = B(n,p) - dot(gamma(p,:),A(n,:))

,其中

gamma(p,k) = dot(A(:,k),B(:,p))/sum( A(:,k).^2 )

在MATLAB中,我有像

这样的代码
for p = 1:P
    for n = 1:N
        for k = 1:K
            gamma(p,k) = dot(A(:,k),B(:,p))/sum(A(:,k).^2);
        end
        x(n,p) = B(n,p) - dot(gamma(p,:),A(n,:));
    end
end

这是非常低效的,因为它使用三个for循环!有没有一种加速这段代码的好方法?

3 个答案:

答案 0 :(得分:4)

在我看来,你可以将伽马计算提升出循环;至少,我没有看到伽玛计算中对N的任何依赖。

这样的事情:

for p = 1:P
    for k = 1:K
        gamma(p,k) = dot(A(:,k),B(:,p))/sum(A(:,k).^2);
    end
end
for p = 1:P
    for n = 1:N
        x(n,p) = B(n,p) - dot(gamma(p,:),A(n,:));
    end
end

我对你的代码(或matlab)不够熟悉,真的知道你是否可以合并这两个循环,但如果可以的话:

for p = 1:P
    for k = 1:K
        gamma(p,k) = dot(A(:,k),B(:,p))/sum(A(:,k).^2);
    end
    for n = 1:N
        x(n,p) = B(n,p) - dot(gamma(p,:),A(n,:));
    end
end

答案 1 :(得分:4)

使用bsxfun进行循环的除法和矩阵乘法:

gamma = bsxfun(@rdivide, B.'*A, sum(A.^2));
x = B - A*gamma.';

这是一个测试脚本

N = 3;
K = 4;
P = 5;

A = rand(N, K);
B = rand(N, P);

for p = 1:P
    for n = 1:N
        for k = 1:K
            gamma(p,k) = dot(A(:,k),B(:,p))/sum(A(:,k).^2);
        end
        x(n,p) = B(n,p) - dot(gamma(p,:),A(n,:));
    end
end

gamma2 = bsxfun(@rdivide, B.'*A, sum(A.^2));
X2 = B - A*gamma2.';

isequal(x, X2)
isequal(gamma, gamma2)

返回

ans =
     1
ans =
     1

答案 2 :(得分:0)

bxfun很慢...... 如下所示(我可能有错误的转置)

modA = A * (1./sum(A.^2,2)) * ones(1,k);
gamma = B' * modA;
x = B - A * gamma';