Question

有没有办法为rpy2会话的R实例预加载库？在进口商调用格子或grdevices时，我花费了25-30％的响应时间（每个图表大约0.5秒），并且如果可能的话，我希望减少。

代码段：

grdevices = importr('grDevices')
importr('lattice')

imagefile = File(open('1d_%s.png' % str(uuid4()), 'w'))
grdevices.png(file=imagefile.name, type='cairo',width=400,height=350)

rcmd="""
print(
    xyplot(yvec~xvec,labels=labels,type=c('p','r'),
            ylab='%s',xlab='%s'
            )
)"""% (y_lab, x_lab)
robjects.r(rcmd)
grdevices.dev_off()

imagefile.close()

如果我不调用importr（“lattice”），robjects.r会对我后来制作的“xyplot（...”调用事件感到不满。我可以使用R_PROFILE或R_ENVIRON_USER加速格子和grdevices调用吗？

Answer 1

importr是一个非常高级别的功能，易于使用的交易性能。除了加载R包之外，它还有很多功能。它还将该包中的所有R对象映射到Python（rpy2）对象。如果未使用结果，则在脚本中执行importr('lattice')时会失去这种努力。

除此之外，在R中导入包本身并非没有成本（对于具有S4类定义的较大R包，当脚本很短时，这可能是显而易见的）。 rpy2对此无能为力。

可以使用R_PROFILE之类的R变量，但默认情况下不会在very recently之前启用。如何启用它是在SO（here）。

现在，importr只占“响应时间的25％”。专注于此的优化工作将无法使其超过25％（这是一个非常乐观的限制）。将数据插入字符串以将其评估为R代码之后不是非常优化（如documentation for rpy2中所述）。考虑通过rpy2调用R函数，将数据作为导出缓冲区接口的任何内容传递（例如）。

在Django中预加载Importr

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