调整stat_smooth行的透明度(alpha),而不仅仅是Confidence Interval的透明度

时间:2013-10-20 06:27:59

标签: r ggplot2 transparency alpha

使用ggplot2的stat_smooth(),我很好奇如何调整生成的回归线的透明度。使用geom_points()或geom_line(),通常会为'alpha'设置一个值,表示透明度百分比。但是,使用stat_smooth(),alpha设置置信区间的透明度(在我的示例中,关闭 - se = FALSE)。

我似乎无法找到使回归线的透明度低于1的方法。

你的建议很棒。

示例代码

 library(reshape2)
 df <- data.frame(x = 1:300)
 df$y1 <-  0.5*(1/df$x + 0.1*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df$y2 <-  0.5*(1/df$x + 0.3*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df$y3 <-  0.5*(1/df$x + 0.6*(df$x-1)/df$x + rnorm(300,0,0.015))
 df <- melt(df, id = 1)

 ggplot(df, aes(x=x, y=value, color=variable)) +
   geom_point(size=2) +
   stat_smooth(method = "lm", formula = y ~ 0 + I(1/x) + I((x-1)/x),
               se = FALSE,
               size = 1.5,
               alpha = 0.5)

enter image description here

2 个答案:

答案 0 :(得分:51)

要为该行设置alpha值,您应将stat_smooth()替换为geom_line(),然后在geom_line()内使用与stat_smooth()中相同的参数,并另外添加{{ 1}}。

stat="smooth"

enter image description here

答案 1 :(得分:7)

作为一种更直观的替代方案 - 也许是在此答案后创建的 - 您可以使用stat_smooth (geom="line")。 SE信封消失了,但你可以用以下内容添加回来:

geom_smooth (alpha=0.3, size=0, span=0.5) stat_smooth (geom="line", alpha=0.3, size=3, span=0.5) +

第一行创建SE。没有(0宽度)线,第二行在其顶部添加线。 (当前)文档提到stat_smooth适用于非标准的geoms(例如“line”)。