快速读取整数矩阵

Question

我正在尝试在 R 中阅读一张大表（大约500000 x 1000）。

read.table有效，但速度非常慢。

scan也有效，并且速度正常，但我无法将其格式更改为正常的data.frame或矩阵。

我事先不知道表格中的行数（我可以通过template_line <- read.table(nrow=1,file=my_file)找到列数）。它需要与 R 2.15兼容 - 所以看起来fread是不可能的。

所以问题是：如何转换输出：

my_matrix <- scan(file=my_file,what=template_line);  

到data.frame或矩阵（快）？

或者：如果我不知道尺寸，如何在 R 中快速读取整数表？

Answer 1

这个怎么样？

num_cols <- 5
my_matrix <- matrix(scan(file=my_file, what=template_line), ncol=num_cols, byrow=TRUE)