GGplot Barplot不接受Y值？

Question

我有一个数据框：

>picard
count    reads
 1    20681318
 2     3206677
 3      674351
 4      319173
 5      139411
 6      117706

如何在ggplot（barplot）上绘制log10（计数）与log10（读数）？

我试过了：

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)))

但它不接受y = log10（读取）。如何绘制y值？

Answer 1

你可以做这样的事情，但是绘制一个不连续的x轴和log10刻度对我来说没有意义：

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10() +
    scale_x_log10()

如果您只想要一个带有log10比例的y轴，只需执行：

ggplot(picard) +
    geom_bar(aes(x=count,y=reads),stat="identity") +
    scale_y_log10()

Answer 2

使用stat="identity"：

ggplot(picard) + geom_bar(aes(x=log10(count),y=log10(reads)), stat="identity")

您实际上会收到警告：

  

将变量映射到y并使用stat =“bin”。     使用stat =“bin”，它将尝试将y值设置为每个组中的个案数。     这可能会导致意外行为，并且在将来的ggplot2版本中将不允许这样做。     如果您希望y表示案例计数，请使用stat =“bin”并且不要将变量映射到y。     如果您希望y表示数据中的值，请使用stat =“identity”。     有关示例，请参阅？geom_bar。 （已弃用;最后一次在0.9.2版本中使用）

Answer 3

有一种直接的方法，即使用geom_col（）函数。只需对您的代码进行微调：

ggplot(picard) + geom_col(aes(x=log10(count), y=log10(reads)))

它将提供与将stat参数设置为identity geom_bar()相同的输出。问题是，geom_bar()使用count作为stat的默认值，因此它不会为y轴采用任何变量。它将简单地使用计数，即x轴的每个值的出现次数，对于它的y轴。我希望这能回答你的问题。