更改轴标签包pheatmap生成的热图的旋转

时间:2013-10-13 11:55:04

标签: r heatmap pheatmap

pheatmap生成的热图的x轴标签默认旋转270度。我需要让它们旋转90度。

我跟踪了pheatmap()函数,看到有一个内部(不可见)函数可以生成标签:

draw_colnames <- function (coln, ...) 
{
    m = length(coln)
    x = (1:m)/m - 1/2/m
    grid.text(coln, x = x, y = unit(0.96, "npc"), vjust = 0.5, 
              hjust = 0, rot = 270, gp = gpar(...))
}

我只是使用以下命令在上面的函数中将rot = 270更改为rot = 90hjust = 0更改为hjust = 1,并且它有效:

fixInNamespace("draw_colnames","pheatmap")

但问题是fixInNamespace()会永久修改包中的函数定义。我更乐意不改变原始函数定义,而是在我需要的情况下暂时用我自己的函数替换draw_colnames()函数的定义。

有没有解决方案?

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