我创建了一个Cython代码,用于在密集矩阵和稀疏向量之间进行矩阵运算,如下所示(因为我正在学习Cython我不确定这是一个很好的代码,但它是我能来的最好的到目前为止):
import numpy as np
cimport numpy as np
ctypedef np.float64_t dtype_t
ctypedef np.int32_t dtypei_t
cimport cython
@cython.boundscheck(False)
@cython.wraparound(False)
@cython.nonecheck(False)
def cdenseXsparse(np.ndarray[dtype_t, ndim = 2] Y,
np.ndarray[dtype_t, ndim = 1] V,
np.ndarray[dtypei_t, ndim = 1] I,
np.ndarray[dtype_t, ndim = 1] A = None):
"""
Computes A = Y * (V_I)
"""
if Y is None:
raise ValueError("Input cannot be Null")
A = np.zeros(Y.shape[1])
cdef Py_ssize_t i, indice
cdef dtype_t s
for i in range(A.shape[0]):
s = 0
for indice in range(len(I)):
s += Y[I[indice], i] * V[indice]
A[i] = s
return A
工作正常。但是当我改变第三行时:
ctypedef np.float64_t dtype_t
为:
ctypedef np.float32_t dtype_t
并编译.pyx文件并再次运行矩阵操作我收到错误:
"Buffer dtype mismatch, expected 'dtype_t' but got 'long'"
例如,在使用np.float32_t进行编译并运行代码时:
In [3]: from numpy import random as rd, array, int32, float32
In [4]: y = array(rd.rand(10, 200), dtype = float32)
In [5]: v = array([1, 2, 3], dtype = float32)
In [6]: i = array([0, 1, 2], dtype = int32)
In [7]: from cdenseXsparse import cdenseXsparse
In [8]: r = cdenseXsparse(y, v, i)
---------------------------------------------------------------------------
ValueError Traceback (most recent call last)
<ipython-input-8-319f9c8c8d49> in <module>()
----> 1 r = cdenseXsparse(y, v, i)
/home/will/workspace/s3_RecSys/SVD/cdenseXsparse.so in cdenseXsparse.cdenseXsparse (cdenseXsparse.c:1484)()
ValueError: Buffer dtype mismatch, expected 'dtype_t' but got 'double'
在Cython中使用float32有不同的方法吗?使用float64和float32不应该以相同的方式工作吗?
对于我到目前为止所研究的内容,它的工作方式应该相同,但在代码中没有。
提前致谢!
答案 0 :(得分:6)
np.zeros的默认行为是创建一个float64数据,如果你想强制数据类型为float32,你应该指定它。您还应该将所有cdef放在函数的开头。