Question

我有这个文件：

rs1    1    ADD     0.7     0.75     0.45
rs1    1    VAR     0.4     4.53     0.06
rs1    1    USER    NA      1.96     0.37
rs2    2    ADD     1.5     0.25     0.23
rs2    2    VAR     0.4     4.86     0.03
rs2    2    USER    NA      1.73     0.05
rs3    3    ADD     0.29    0.76     0.97
rs3    3    VAR     0.44    3.95     0.09
rs3    3    USER    0.96    5.41     0.01

对于$1中的每个值，ADD中有三行VAR，USER，$3。我想根据$6中USER行的$3值对文件进行排序（反向排序）。问题是我如何能够这样做并同时在排序的行旁边保留ADD，VAR的相应行。我不需要对其他两行进行排序;我只需将它们放在sorted行的旁边。

期望的输出：

 rs3    3    ADD     0.29    0.76    0.97
 rs3    3    VAR     0.44    3.95    0.09
 rs3    3    USER    0.96    5.41    0.01
 rs2    2    ADD     1.5     0.25    0.23
 rs2    2    VAR     0.4     4.86    0.03
 rs2    2    USER    NA      1.73    0.05
 rs1    1    ADD     0.7     0.75    0.45
 rs1    1    VAR     0.4     4.53    0.06
 rs1    1    USER    NA      1.96    0.37

我已尝试过此代码，但只根据$6行中的USER值进行排序：

cat File | sort -k1 | uniq | sort -g -k6 > Output

谢谢

Answer 1

这有点乱，但你做了什么：

paste - - - < File | sort -k18,18g | xargs -n 6

输入格式的问题是sort无法对输入行组进行操作，因此您需要将每个组转换为一行，对其进行排序，然后将其转回。这只适用于输入＆＃34; USER＆＃34; line总是在组中的最后一行。

Answer 2

这是Ruby的单行代码：）

ruby -e 'File.open(ARGV.shift).readlines.entries.group_by{|e| e.split[1]}.sort.reverse.each{|e| puts e[1]}' file

输出：

rs3    3    ADD     0.29    0.76     0.97
rs3    3    VAR     0.44    3.95     0.09
rs3    3    USER    0.96    5.41     0.05
rs2    2    ADD     1.5     0.25     0.23
rs2    2    VAR     0.4     4.86     0.03
rs2    2    USER    NA      1.73     0.01
rs1    1    ADD     0.7     0.75     0.45
rs1    1    VAR     0.4     4.53     0.06
rs1    1    USER    NA      1.96     0.37

如何将一组线组合在一起？

2 个答案: