我正在进行分析,如果依赖突变基因增加或减少,使用3个或更多基因使用fisher精确检验。我成功地使用fisher.test()
对两个基因进行了分析。 2x2 contigency表的示例:
Gene A mutated | Gene A normal
Gene B mutated| 26 | 12
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Gene B normal | 10 | 50
现在我想知道如何对3个基因进行分析(并构建列联表),如下所示:基因A突变,基因A正常,基因B突变,基因B正常,基因C突变和基因C正常。
如何使用此fisher.test()
函数使用此数据执行fisher测试(3x3 contigency表)?