我有一个脚本可以将CSV文件中的数据读入data.table
,然后将一列中的文本拆分为几个新列。我目前正在使用lapply
和strsplit
函数执行此操作。这是一个例子:
library("data.table")
df = data.table(PREFIX = c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"),
VALUE = 1:6)
dt = as.data.table(df)
# split PREFIX into new columns
dt$PX = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 1))
dt$PY = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 2))
dt
# PREFIX VALUE PX PY
# 1: A_B 1 A B
# 2: A_C 2 A C
# 3: A_D 3 A D
# 4: B_A 4 B A
# 5: B_C 5 B C
# 6: B_D 6 B D
在上面的示例中,{_ 1}列列在“_”字符上分为两个新列PREFIX
和PX
。
尽管这很好用,但我想知道是否有更好(更有效)的方法来使用PY
来实现这一点。我的真实数据集有> = 10M +行,因此时间/内存效率变得非常重要。
按照@ Frank的建议,我创建了一个更大的测试用例并使用了建议的命令,但data.table
比原始方法花了更长的时间。
stringr::str_split_fixed
因此library("data.table")
library("stringr")
system.time ({
df = data.table(PREFIX = rep(c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"), 1000000),
VALUE = rep(1:6, 1000000))
dt = data.table(df)
})
# user system elapsed
# 0.682 0.075 0.758
system.time({ dt[, c("PX","PY") := data.table(str_split_fixed(PREFIX,"_",2))] })
# user system elapsed
# 738.283 3.103 741.674
rm(dt)
system.time ( {
df = data.table(PREFIX = rep(c("A_B","A_C","A_D","B_A","B_C","B_D"), 1000000),
VALUE = rep(1:6, 1000000) )
dt = as.data.table(df)
})
# user system elapsed
# 0.123 0.000 0.123
# split PREFIX into new columns
system.time ({
dt$PX = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 1))
dt$PY = as.character(lapply(strsplit(as.character(dt$PREFIX), split="_"), "[", 2))
})
# user system elapsed
# 33.185 0.000 33.191
方法需要大约20倍的时间。
答案 0 :(得分:93)
更新:从版本1.9.6(截至2015年9月的CRAN),我们可以使用函数tstrsplit()
直接获取结果(并且以更有效的方式) ):
require(data.table) ## v1.9.6+
dt[, c("PX", "PY") := tstrsplit(PREFIX, "_", fixed=TRUE)]
# PREFIX VALUE PX PY
# 1: A_B 1 A B
# 2: A_C 2 A C
# 3: A_D 3 A D
# 4: B_A 4 B A
# 5: B_C 5 B C
# 6: B_D 6 B D
tstrsplit()
基本上是transpose(strsplit())
的包装器,其中最近实现的transpose()
函数转置了一个列表。有关示例,请参阅?tstrsplit()
和?transpose()
。
查看旧答案的历史记录。
答案 1 :(得分:13)
我为不使用data.table
v1.9.5 的人添加了答案,并且还想要一行解决方案。
dt[, c('PX','PY') := do.call(Map, c(f = c, strsplit(PREFIX, '-'))) ]
答案 2 :(得分:5)
使用splitstackshape
包:
library(splitstackshape)
cSplit(df, splitCols = "PREFIX", sep = "_", direction = "wide", drop = FALSE)
# PREFIX VALUE PREFIX_1 PREFIX_2
# 1: A_B 1 A B
# 2: A_C 2 A C
# 3: A_D 3 A D
# 4: B_A 4 B A
# 5: B_C 5 B C
# 6: B_D 6 B D
答案 3 :(得分:0)
使用tidyr,解决方案是:
separate(df,col = "PREFIX",into = c("PX", "PY"), sep = "_")
答案 4 :(得分:-1)
那??? fread(text = dt $ PREFIX)