如何使用spin（）knitr生成报告并在pdf中保存一些图

Question

我对knitr包装有点失落。 我喜欢spin（）函数快速给我一个全局的分析视图，但我需要在单独的pdf中保存一些非常重要的图（例如我的文件的第8个图应保存为“Figure1.pdf”并显示在报告中）。

当我写：

Some random code and plots...

pdf('Figure1.pdf')
plot(important plot)
dev.off()

Some random code and plots

旋转（）后，重要的情节不会显示在报告中，我希望在报告和pdf中。

有什么办法吗？

由于

Answer 1

spin()会保存所有绘图，但默认会保存PNG格式的绘图，因为参数spin(..., format = 'Rmd')（R Markdown使用PNG设备）。

您也可以在R脚本中指定块选项：只需使用#+或#-，例如

#' Some random code and plots...

#+ Figure1, fig.path='', dev=c('png', 'pdf')
plot(important plot)

#' Some random code and plots

注意dev选项采用设备向量，如@baptiste所述。

或者您使用Rnw格式，例如（您无需指定dev）

spin(..., format = 'Rnw')

在这种情况下，输出将是LaTeX / PDF而不是HTML。

Answer 2

如果我理解了这个问题，那么关闭设备后重复绘图语句就可以了，而不会在报告中产生副本：

Some random code and plots...

pdf('Figure1.pdf')
plot(important plot)
dev.off()
plot(important plot)

Some random code and plots