Question

预先：在knitr中使用pandoc()，在尝试将.md或.Rmd编译为PDF时会抱怨。

我正在简化可重复研究的过程，正如许多地方所记录的那样。我正在使用pandoc和knitr并制作出色的文档。我也试图精简一些不熟悉编程的同事，但我们正试图使用类似的文件。 “用户友好”以降价为中心的编辑器有几种选择，出于几个原因，我倾向于使用RStudio（对于他们来说，emacs / ess对我而言，但这有所不同）。

我的工作流程：给他们一个markdown（.md或.Rmd）文件，让他们能够进行更改，并可选择将其重新呈现为PDF。不幸的是，RStudio不允许（AFAICT）允许设置模板或其他任意pandoc配置参数（例如章节，数字部分），因此在R / knitr中使用pandoc()在这里很有意义。

使用whitepaper.Rmd作为输入文件，我在R中运行pandoc('whitepaper.Rmd', 'pdf')并立即获得：

> pandoc('whitepaper.Rmd', 'pdf')
executing pandoc  -t latex --standalone --smart --number-sections --template=report.tex -f markdown -t pdf -o whitepaper.pdf "whitepaper.Rmd"
pandoc.exe: cannot produce pdf output with pdf writer
Error in (function (input, format, ext, cfg)  : conversion failed

我在特定于knitr的标题中明确地有“t：latex”，但没有它，pandoc()仍在向系统调用添加“-t pdf”，pandoc.exe不接受

通过故障排除，如果我删除'-t pdf'，该命令就可以正常工作，因此输入文件本身似乎没有任何问题：

> system('pandoc  -t latex --standalone --smart --number-sections --template=report.tex -f markdown -o whitepaper.pdf "whitepaper.Rmd"')

关于此主题还有许多其他对话：14586177，14508429，15258233以及经过深思熟虑的11025123。他们都解决了需要命令行工作，额外中间步骤，外部Makefile或knit2pdf()（使用texi2pdf，不需要）的解决方案。

我看到它们的约束：

在R环境中轻松操作;
利用Yihui的“”文件内配置（允许我继续在我的模板之间任意切换，为几个例子之一;）
最好使用单个“标准化”命令执行此操作（即“pandoc('whitepaper.Rmd', 'pdf')”）。

...这样，一旦参数在文件中设置，编辑和重新渲染就相对来说已经死了。

我可以修补和覆盖Yihui的knitr:::pandoc_one()以删除'-t'和格式的冒犯性添加，但我想知道其他地方可能有哪些副作用。这种解决方案不可持续，也不是“正确的方式（tm）”。

建议“正确的方式（tm）”来解决这个问题？我错过了一个简单/明显的解决方案吗？

顺便说一句：谢谢，谢毅辉，针织者，约翰麦克法兰，pandoc。迷死人！（也许我可以向其中一个或两个提交补丁建议来解决我的用例，但如果它只是我那么它可能不值得。）

Answer 1

我认为您需要的所有信息都在?pandoc中，其中包含运行system("pandoc -h")以查看可能的输出格式的示例。从中你了解到

输出格式：asciidoc，beamer，context，docbook，docx，dzslides， epub，epub3， fb2，html，html5，json，latex，man，markdown，markdown_github， markdown_mmd，markdown_phpextra，markdown_strict，mediawiki， native，odt，opendocument，opml，org，pdf *，plain，revealjs， rst，rtf，s5，slideous，slidy，texinfo，textile [*用于pdf输出，使用乳胶或投影仪和-o FILENAME.pdf]

基本上format = "pdf"无效，您应该使用pandoc("tmp.Rmd", format = "latex", ext = "pdf")（根据ext="pdf"，?pandoc部分是默认的，所以您真正需要的是{ {1}}）。至于pandoc("tmp.Rmd", "latex")导致与pandoc('whitepaper.Rmd', 'pdf')通话的原因，您告诉它在-t pdf来电的第二个参数中执行此操作。

knitr pandoc：“无法用pdf writer生成pdf输出”

1 个答案: