knitr已停止输出情节

时间:2013-06-23 11:23:55

标签: r knitr

我最近遇到了R中knitr的问题,突然停止制作情节。它没有报告任何问题和问题。只是那个制作情节的块(原生R或ggplot2)什么都不做。块被评估,但不知何故被视为没有R代码的块。

我已将问题简化为最小的例子,但不知道出了什么问题。整个文件可以在http://pastebin.com/pJUYjkxd找到,并且只有一个块。应该很简单吗?

<<mas11,dev='png'>>=
plot(x=1:10, y=rnorm(10))
@

但编织它会产生以下输出(使用R版本2.14.1):

Rscript --vanilla  -e "library(knitr); knit('test.dev.2.Rnw');"


processing file: test.dev.2.Rnw
  |>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>                                           |  33%
  ordinary text without R code

  |>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>                      |  67%
label: mas11 (with options) 
List of 1
 $ dev: chr "png"

  |>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>>| 100%
  ordinary text without R code


output file: /home/stefan/Repos/manuscript1/datahandling/test.dev.2.tex

最终的pdf文件为enter image description here 在那里你可以看到大块已被回应。

我不知道如何解决这个问题! 请帮助。

更新

> sessionInfo()
R version 2.14.1 (2011-12-22)
Platform: i686-pc-linux-gnu (32-bit)

locale:
 [1] LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
 [3] LC_TIME=en_DK.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
 [5] LC_MONETARY=en_DK.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
 [7] LC_PAPER=C                 LC_NAME=C                 
 [9] LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
[11] LC_MEASUREMENT=en_DK.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       

attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] knitr_0.8

loaded via a namespace (and not attached):
[1] digest_0.5.2   evaluate_0.4.3 formatR_0.6    plyr_1.8       stringr_0.6.1 
[6] tools_2.14.1  

1 个答案:

答案 0 :(得分:-2)

fig = TRUE&#34;&lt;&lt;&gt;&gt; =&#34;为我工作!

问题出在&#34; &lt;&gt; = &#34; 来自:

\documentclass{article}
\begin{document}
\title{A Minimal Example}
\author{Yihui Xie}
\maketitle
We examine the relationship between speed and stopping
distance using a linear regression model:
$Y = \beta_0 + \beta_1 x + \epsilon$.
<<model, fig.width=4, fig.height=3, fig.align='center'>>=
par(mar = c(4, 4, 1, 1), mgp = c(2, 1, 0), cex = 0.8)
plot(cars, pch = 20, col = 'darkgray')
fit <- lm(dist ~ speed, data = cars)
abline(fit, lwd = 2)
@
The slope of a simple linear regression is
\Sexpr{coef(fit)[2]}.
\end{document}
谢毅辉(2013-09-09)。带R和knitr的动态文档(Chapman&amp; Hall / CRC R系列)(页13)。泰勒和弗朗西斯CRC电子书帐户。 Kindle版。

最佳,

罗伯特