如何用R绘制兼容性？

Question

我在文献中找到了关于协调性（用于网络）的图。我想以与R＆amp; S类似的方式绘制我的网络。 igraph。 图表上的每个点都对应一个网络边缘。在我的情况下，x轴应表示源节点的度数，y轴应表示目标节点的度数。我是R的初学者，因此如果有人能帮助我策划这个，我将非常感激。

我现在使用了Vincent Zoonekynd的代码并得到了下图。但是我觉得它仍然没有表现出正确的东西。轴上的节点应按其度数排序。当我看到该情节时，我看到一些高度的节点围绕轴标记42,100或175。这没有多大意义。这里的排名过程有问题吗？

A <- get.adjacency(USAN_g_num)            
image(A,  ylim=c(0,627))             
i <- rank( degree(USAN_g_num), na.last=NA, ties.method="first" )
image(A[i,i], ylim=c(0,627)) 

（我在代码中添加了一个ylim，以便在左下角和右上角的同一角落中绘制低 - 低度和高 - 高度） 但是我的情节应该与我上面展示的情节有所不同是正确的，因为我的数据是不相称的。

Answer 1

它看起来像图的邻接矩阵， 节点按度数排序。

# Sample data
library(igraph)
library(Matrix)
g <- erdos.renyi.game(10, p=1/2) + erdos.renyi.game(10, p=1/2)

# Plot the adjacency matrix
A <- get.adjacency(g)
image(A)

# In this example, sorting the nodes by degree is not a good idea
i <- order( degree(g) )
image(A[i,i])